La stimulation magnétique transcrânienne (TMS - transcranial magnetic stimulation) est une technique de stimulation cérébrale non invasive et indolore qui implique un courant magnétique généré par une bobine placée sur le scalp d'un sujet. Dans son mode répétitif (rTMS), en fonction des fréquences de stimulation employées, il a été montré qu'elle permettait de faciliter ou d'inhiber l'excitabilité corticale, entraînant des modifications comportementales de manière sécurisée, sans effet secondaire grave. De par ses capacités de modulation des circuits cérébraux, la rTMS peut constituer un traitement non pharmacologique de choix. Depuis maintenant plus de 20 ans, les effets thérapeutiques de la rTMS ont été évalués dans plusieurs indications en psychiatrie. D'après les recommandations françaises publiées en 2011 et les recommandations européennes de 2014, les niveaux de preuve de la rTMS comme traitement des symptômes réfractaires à la pharmacologie pour les symptômes négatifs ou les hallucinations auditives chez les patients souffrant de schizophrénie sont respectivement de rangs B et C, et de rang A dans le traitement de l'épisode dépressif caractérisé comme étant unipolaire. Néanmoins, certaines interrogations persistent concernant les schémas de cure optimaux, la durée de l'effet et les facteurs pronostiques de bonne réponse. De plus, il n'existe pas encore de reconnaissance de ce dispositif par les autorités sanitaires françaises et sa place dans l'arsenal thérapeutique des troubles psychiatriques reste à clarifier. Cet article propose une synthèse des recommandations afin de guider le praticien vers des choix thérapeutiques psychiatriques adaptés. La mise en œuvre de futurs essais cliniques contrôlés randomisés incluant des populations plus homogènes, avec des paramètres de stimulation argumentés pour chaque indication, permettra de mieux étayer les recommandations actuelles et de favoriser le déploiement de cette méthode prometteuse.