L'imagerie fonctionnelle correspond à deux grands types de techniques : les techniques dérivées de l'imagerie par résonance magnétique (IRM) - IRM fonctionnelle essentiellement, mais aussi spectroscopie IRM, et IRM de diffusion et perfusion - et les techniques dérivées de l'imagerie nucléaire - tomographie par émission de positons (TEP) et tomographie d'émission monophotonique (TEMP). Ces techniques peuvent être utilisées seules ou de façon combinée (imagerie plurimodalitaire). Dans le cadre de l'épilepsie, l'imagerie fonctionnelle est utilisée dans deux principaux champs d'application : l'exploration préchirurgicale des patients pharmacorésistants (aide à la localisation du foyer épileptogène et à la planification de l'étendue du geste chirurgical) et la recherche clinique.