Selon l'importance des facteurs génétiques, on distingue les dyslipoprotéinémies monogéniques, rares, et les formes polygéniques ou multifactorielles, beaucoup plus fréquentes. Dans la majorité des formes monogéniques, les gènes concernés ont été identifiés et la recherche des mutations causales, dans un cadre réglementaire strict défini par les lois de bioéthique, apporte un diagnostic de certitude : identification de la mutation chez le cas index, recherche de cette mutation chez les apparentés à risque (dépistage familial) et diagnostic prénatal dans les formes particulièrement graves (risque d'hypertriglycéridémie ou d'hypercholestérolémie familiales homozygotes). Cependant, pour les dyslipidémies autosomiques dominantes, les phénomènes de pénétrance et de variabilité d'expression ne permettent pas de prédire la sévérité de la maladie uniquement par la caractérisation de la mutation. En pratique, après avoir éliminé une dyslipidémie secondaire ou multifactorielle, les résultats de l'exploration d'une anomalie lipidique vont orienter l'analyse moléculaire vers les gènes le plus souvent impliqués dans un cadre nosologique précis. Une fois la mutation identifiée chez le cas index et sa pathogénicité établie, elle peut être facilement détectée chez les apparentés à risque, par des techniques ciblées. Dans l'hypercholestérolémie autosomique dominante, le dépistage familial moléculaire s'est révélé plus sensible et plus spécifique que le dépistage familial par simple bilan lipidique. En effet, le dépistage biochimique se heurte à la grande fréquence des faux négatifs et des faux positifs, en raison du chevauchement des taux plasmatiques chez les sujets sans mutation (population de référence) et les sujets porteurs d'une mutation. Enfin, les travaux de recherches actuels devraient permettre de proposer, dans un avenir proche, un diagnostic moléculaire des facteurs génétiques de prédisposition aux dyslipoprotéinémies multifactorielles.