De nombreuses espèces mycobactériennes, dites atypiques ou non tuberculeuses, peuvent être à l'origine d'infections humaines, appelées mycobactérioses, chez l'homme. Seules les mycobactérioises cutanées sont abordées dans ce chapitre. Deux d'entre elles, parmi les plus fréquentes, surviennent chez le sujet immunocompétent. Il s'agit de l'ulcère de Buruli (dû à Mycobacterium ulcerans) devenu la deuxième infection à mycobactéries devant la lèpre dans un grand nombre de pays de la zone intertropicale, et du « granulome des piscines » ou « granulome des aquariums » (dû à Mycobacterium marinum) dans les pays de l'hémisphère nord. Les autres mycobactéries responsables d'infections cutanées surviennent préférentiellement en cas d'immunodépression locale ou générale. Les mycobactérioses survenant en cas d'immunodépression locale (mésothérapie, chirurgie) sont essentiellement dues à M. fortuitum, M. chelonae, M. abscessus et M. xenopi. Les mycobactérioses survenant en cas d'immunodépression générale (infection par le virus de l'immunodéficience humaine [VIH], transplantés) sont essentiellement dues à M. haemophilum et M. kansasii. Dans tous les cas, mais plus encore en cas d'immunodépression, ces infections cutanées peuvent s'étendre aux tissus profonds, voire disséminer dans l'organisme. Pour toutes ces infections, le seul diagnostic de certitude est la mise en évidence de la mycobactérie. L'identification précise de l'espèce en cause est indispensable pour l'adaptation du traitement (médical et/ou chirurgical) qui diffère selon l'espèce. Cette identification a été grandement améliorée ces dix dernières années grâce aux techniques de biologie moléculaire. Cependant, il est important de garder en mémoire que, mis à part pour M. ulcerans et M. marinum, considérées comme des pathogènes vrais, la présence d'une mycobactérie atypique dans un prélèvement cutané doit être confrontée aux données cliniques et radiologiques, afin de différencier une réelle infection d'une colonisation de l'hôte.