La proctocolectomia totale con anastomosi ileoanale (AIA) rappresenta il trattamento di riferimento della poliposi adenomatosa familiare e della rettocolite ulcerosa. Potrebbe anche essere proposta in alcuni casi molto selezionati di malattia di Crohn del colon senza lesioni anali né del tenue. Vi sono due tecniche principali di AIA: la tecnica di riferimento è la AIA con anastomosi manuale dopo mucosectomia (tecnica di Parks) e l'AIA con anastomosi meccanica, che è di gran lunga la più impiegata nel mondo. È possibile impiegare una terza tecnica con eversione rettale e sezione sulla linea pettinata (tecnica di Hautefeuille) che potrebbe evitare l'inconveniente di lasciare una quota di mucosa di transizione in caso di AIA meccanica e di eseguire una mucosectomia incompleta in caso di tecnica di Parks. Infine, nelle mani di equipe esperte, è oggi possibile realizzare questo intervento con accesso laparoscopico.