Le dépistage des patients porteurs de bactéries multirésistantes épidémiques, à l'admission ou en cours d'hospitalisation, est recommandé par les programmes de maîtrise de la diffusion des bactéries multirésistantes. Les échantillons permettant d'identifier les patients colonisés comprennent au minimum un écouvillonnage nasal pour les Staphylococcus aureus résistants à la méticilline, ou rectal pour les entérobactéries productrices de β-lactamase à spectre étendu ou les entérocoques résistants à la vancomycine. Le traitement des échantillons au laboratoire comprend la culture sur milieux sélectifs avec ou sans étape d'enrichissement en milieu liquide, l'identification de la bactérie et la détection du mécanisme de résistance aux antibiotiques.

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