Les prostatites chroniques sont d'origine infectieuse dans 5 % à 10 % des cas et les autres entités sont appelées syndrome douloureux pelvien chronique ou chronic pelvic pain syndrome (CPPS), d'étiologies inconnues ou hypothétiques. Les classifications ont évolué dans le temps et restent basées historiquement sur des épreuves bactériologiques des sécrétions prostatiques. Le bilan comporte des examens destinés à exclure d'autres affections aux symptômes similaires. Un questionnaire d'évaluation, le National Institute of Health - Chronic Prostatitis Symptom Index (NIH-CPSI), est validé et recommandé. Le concept de « phénotype clinique UPOINT » propose six domaines (urinaire, psychosocial, spécifique d'un organe, infectieux, neurologique et systémique et relatif à la tension musculaire). Ce concept permettrait de mieux orienter le traitement en fonction du phénotype de chaque patient. Un traitement d'essai de 15jours d'antibiotiques associé ou non à un alphabloquant reste recommandé mais empirique. En fonction de la réponse clinique, il est poursuivi ou remplacé par des traitements de support. D'autres traitements ont été essayés et évalués comme les inhibiteurs de la 5-alpharéductase, les anti-inflammatoires, la phytothérapie, l'allopurinol, des antidépresseurs et anticonvulsivants, les ondes de choc extracorporelles entre autres. Peu d'études de niveau 1 d'évidence ont apporté une preuve d'efficacité. Le rôle des traitements « de support » et de soutien psychique est majeur. Le CPPS reste une entité à l'étiologie controversée dont les traitements sont empiriques.