Les techniques extracorporelles (lithotritie extracorporelle) et endoscopiques (néphrolithotomie percutanée et urétéroscopie rigide ou souple) ont considérablement réduit les indications de chirurgie conventionnelle qui, il y a plus de 30 ans, était la seule option pour traiter les calculs urinaires. Ces indications concernent des gros calculs (> 2 cm), uniques ou regroupés en amas, facilement accessibles et situés soit dans un bassinet extrasinusal, soit dans l'uretère lombaire ou iliaque, des calculs situés dans des diverticules sans parenchyme ou avec peu de parenchyme adjacent, des calculs ayant détruit tout ou partie d'un rein avec nécessité de réaliser une néphrectomie totale ou partielle et enfin des calculs associés à une anomalie nécessitant une réparation chirurgicale spécifique comme le syndrome de la jonction pyélo-urétérale ou une sténose urétérale nécessitant une résection urétérale segmentaire. La laparoscopie peut se substituer le plus souvent à la chirurgie conventionnelle à condition qu'elle soit maîtrisée par les équipes en question.