La coqueluche est une infection respiratoire bactérienne strictement humaine, gravissime pour les nouveau-nés et parfois pour les personnes âgées et les femmes enceintes. Les agents de la maladie sont les bactéries Bordetella pertussis et Bordetella parapertussis. Ces bactéries, qui sécrètent toxines et adhésines, sont responsables des effets cytopathogènes locaux et systémiques observés lors de la maladie tels que la destruction de l'épithélium respiratoire cilié et l'hyperlymphocytose. La vaccination intensive des enfants avec des bactéries tuées a entraîné la diminution de la mortalité et de la morbidité dans la plupart des pays développés. Cependant, la généralisation de la vaccination a aussi mis en évidence que l'immunité naturelle tout comme l'immunité vaccinale est de durée limitée. Dans les populations vaccinées, un changement de transmission de la maladie a été observé, les adultes contaminent les nourrissons non vaccinés, pour qui la maladie peut être mortelle. Grâce au développement de vaccins sous-unitaires ne contenant que quelques protéines bactériennes purifiées et inactivées, des rappels vaccinaux pour l'adolescent et l'adulte ont pu être introduits dans plusieurs pays européens, l'Australie et l'Amérique du Nord. Avec une augmentation de la couverture vaccinale, un meilleur contrôle de la maladie devrait être obtenu. La surveillance passe par l'utilisation de diagnostics biologiques spécifiques car la clinique peut être atypique chez les adolescents et adultes anciennement vaccinés. Ces diagnostics sont en priorité la culture, afin de suivre l'évolution des isolats sous pression vaccinale, et la polymerase chain reaction en temps réel, diagnostic très sensible et rapide. Ces diagnostics sont remboursés. Ils permettent la mise en place d'un traitement par macrolide, pour la personne infectée mais aussi pour son entourage, afin d'arrêter la transmission de cette maladie très contagieuse.