Les maladies chroniques de l'intestin comprennent les maladies inflammatoires chroniques de l'intestin, dont la maladie de Crohn et la rectocolite hémorragique, la maladie cœliaque et une pathologie rare, la maladie de Hirschsprung. Ces pathologies ont une origine mixte, génétique et environnementale. Leurs pics d'incidence concernent la population en âge de procréer et interfèrent à ce titre, avec leur fonction de reproduction. Cet article tend à présenter une synthèse des données actuelles pour constituer une sorte de guide des bonnes pratiques, utile lors de la prise en charge spécialisée de ces patientes en désir de maternité.