Les complications crâniennes et endocrâniennes des sinusites aiguës sont grevées d'un taux de mortalité et de séquelles non négligeable. Elles doivent être recherchées devant l'apparition de tout signe neurologique chez un patient présentant une sinusite aiguë, ou d'une céphalée évoluant en deux temps (céphalée localisée s'améliorant initialement avant de s'aggraver et de devenir plus diffuse). Les sinus frontaux et sphénoïdaux en sont le plus souvent la cause. Le scanner des sinus et de l'encéphale avec injection de produit de contraste est l'examen de première intention ; il est dans certains cas complété par une imagerie par résonance magnétique (IRM) cérébrale. Le traitement, agressif, repose sur le drainage du sinus concerné et une antibiothérapie à large spectre, secondairement adaptée aux prélèvements bactériologiques. Un geste endonasal est parfois proposé, mais il doit si possible rester limité, du fait du risque d'accident iatrogène dans un climat hémorragique et inflammatoire. Dans certaines situations, un drainage neurochirurgical de collections profondes peut également être réalisé. Dans tous les cas, l'amélioration clinique doit être obtenue dans les 48 heures : dans le cas contraire, il faut répéter l'imagerie et discuter un geste complémentaire. Les sinusites fongiques invasives, au premier rang desquelles la mucormycose, constituent une entité à part. Elles doivent être évoquées devant tout symptôme rhinosinusien chez un malade immunodéprimé. Leur traitement passe par la correction maximale de l'immunodépression, le débridement répété des tissus infectés, et l'administration d'antifongiques par voie générale.