Médecine

Paramédical

Autres domaines


S'abonner

Apport des puces à ADN dans le diagnostic étiologique des pleurésies : étude de faisabilité - 18/04/08

Doi : RMR-09-2007-24-7-0761-8425-101019-200720092 

L. Greillier [1 et 2],

P. Roll [3],

F. Barlesi [1],

A. Robaglia-Schlupp [3],

A. Fraticelli [1 et 2],

P. Cau [3],

P. Astoul [1 et 2]

Voir les affiliations

Bienvenue sur EM-consulte, la référence des professionnels de santé.
Article gratuit.

Connectez-vous pour en bénéficier!

Résumé

Introduction

Le diagnostic étiologique des pleurésies exsudatives est parfois difficile, particulièrement celui de mésothéliome pleural malin (MPM). Ainsi, le développement de nouveaux outils biologiques est nécessaire. L'objectif de cette étude était de déterminer la faisabilité et l'apport diagnostique de l'analyse génomique, à l'aide de puces à ADN, des cellules contenues dans le liquide pleural.

Méthodes

Les patients présentant un épanchement pleural, nécessitant une ponction à visée diagnostique, étaient éligibles pour participer à l'étude. Cinq cents ml de liquide pleural étaient recueillis. Après extraction de l'ARN des cellules surnageantes et évaluation de son intégrité, l'expression des gènes était étudiée à l'aide de puces à ADN pan-génome.

Résultats

Dix-sept patients ont été inclus (4 MPM, 8 pleurésies malignes secondaires, 5 pleurésies bénignes). Trois patients présentaient des prélèvements entièrement exploitables. Les expériences de contrôle montraient que l'analyse du transcriptome était reproductible. La comparaison des prélèvements deux à deux montrait des différences significatives en terme d'expression génique. Les prélèvements de 14 patients n'étaient pas exploitables en raison d'une dégradation de l'ARN.

Conclusions

L'étude du transcriptome des cellules contenues dans le liquide pleural est faisable mais reste soumise à des difficultés essentiellement liées à la fragilité de l'ARN.

Abstract

Role of DNA microarrays in the diagnosis of pleural exudates: a feasibility study

Introduction

Establishing the cause of exudative pleural effusions is sometimes difficult, especially in the context of possible malignant pleural mesothelioma (MPM). Therefore, the development of new biological tools is necessary. The aim of this study was to determine the feasibility and the diagnostic contribution of genomic analysis of cells contained in pleural fluid, using DNA microarray techniques.

Methods

Patients with pleural effusion requiring diagnostic thoracocentesis were eligible to participate in the study. Five hundred mls of pleural fluid were then collected. RNA was extracted from pleural fluid cells and its integrity was assessed. Gene expression was studied using pangenomic DNA microarrays.

Results

Seventeen patients were included (4 MPM, 8 secon-dary malignant pleurisies, 5 benign pleurisies). Three patients offered fully exploitable samples. Taking into account the results of control experiments, gene expression study from pleural fluid was reproducible. The comparison of samples showed significant differences in gene expression. Samples from 14 patients were not exploitable because of RNA degradation.

Conclusions

Gene expression study of cells from pleural fluid is feasible but remains difficult, essentially in relationship with RNA weakness.


Mots clés : Analyse de l'expression des gènes , Diagnostic , Exsudat , Mésothéliome pleural , Puces à ADN

Keywords: Gene expression profiling , Diagnosis , Exudate , Malignant pleural mesothelioma , DNA microarray


Plan



© 2007 Elsevier Masson SAS. Tous droits réservés.
Ajouter à ma bibliothèque Retirer de ma bibliothèque Imprimer
Export

    Export citations

  • Fichier

  • Contenu

Vol 24 - N° 7

P. 859-867 - septembre 2007 Retour au numéro
Article précédent Article précédent
  • Empyème après chirurgie d'exérèse pulmonaire : étude de la diffusion pleurale de l'amoxicilline et de la vancomycine
  • J.B. Stern, Y. Péan, P. Girard, M.D. Kitzis, R. Caliandro, R. Grima, D. Gossot, D. Debrosse, O. Schussler, P. Magdeleinat
| Article suivant Article suivant
  • Tuberculose et diabète
  • N.O. Touré, Y. Dia Kane, A. Diatta, S. Ba Diop, A. Niang, E.M. Ndiaye, K. Thiam, F.B.R. MBaye, M. Badiane, A.A. Hane

Bienvenue sur EM-consulte, la référence des professionnels de santé.
L’accès au texte intégral de cet article nécessite un abonnement ou un achat à l’unité.

;

Mon compte


Plateformes Elsevier Masson

Déclaration CNIL

EM-CONSULTE.COM est déclaré à la CNIL, déclaration n° 1286925.

En application de la loi nº78-17 du 6 janvier 1978 relative à l'informatique, aux fichiers et aux libertés, vous disposez des droits d'opposition (art.26 de la loi), d'accès (art.34 à 38 de la loi), et de rectification (art.36 de la loi) des données vous concernant. Ainsi, vous pouvez exiger que soient rectifiées, complétées, clarifiées, mises à jour ou effacées les informations vous concernant qui sont inexactes, incomplètes, équivoques, périmées ou dont la collecte ou l'utilisation ou la conservation est interdite.
Les informations personnelles concernant les visiteurs de notre site, y compris leur identité, sont confidentielles.
Le responsable du site s'engage sur l'honneur à respecter les conditions légales de confidentialité applicables en France et à ne pas divulguer ces informations à des tiers.