La physiopathologie du reflux gastro-œsophagien (RGO) est multifactorielle avec des mécanismes qui peuvent s'associer entre eux et qui aboutissent à un déséquilibre entre les facteurs protégeant la muqueuse œsophagienne et ceux qui favorisent son agression. L'ascension d'une partie du contenu gastrique dans l'œsophage, et spécialement celui de l'acide, est le facteur principal de production des symptômes et/ou des lésions muqueuses œsophagiennes qui distinguent le RGO pathologique du RGO physiologique, essentiellement postprandial. La défaillance de la barrière antireflux est considérée comme le mécanisme principal du RGO pathologique. Mais l'altération de la clairance œsophagienne, l'extension en hauteur du RGO dans l'œsophage, l'agressivité du liquide qui reflue, la défaillance de la résistance muqueuse de l'œsophage, une hypersensibilité œsophagienne sont, avec un ralentissement de la vidange gastrique, les autres facteurs importants dans la genèse des symptômes et la survenue de lésions d'œsophagite.