Comparison of the solution structures of a DNA dodecamer using NOE and residual dipolar coupling data - 01/01/04
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Résumé |
The solution structure of a DNA dodecamer is determined by combining dipolar cross-relaxation and residual dipolar coupling (RDCs) data. The 13C-1H RDCs result from the partial alignment of the molecule after its dissolution in different oriented dilute liquid crystals: polyethylene glycols, bicelles and phages. It clearly appears that thanks to the use of RDCs, the global curvature of the duplex solution structures is reduced. This is shown to result from the use of long-range RDC restraints and from the symmetry properties of a self-complementary dodecamer. To cite this article: F. Alvarez-Salgado, et al., C.R. Chimie 7 (2004).
Résumé |
La structure en solution d'un dodécamère d'ADN d(GACTGTACAGTC)2 est déterminée en combinant les informations de vitesses de relaxation croisée et les couplages dipolaires résiduels 13C-1H (RDCs) sont dus à l'alignement partiel de la molécule induit par sa dissolution dans des cristaux liquides dilués orientés : polyethylène glycols, bicelles et phages. Grâce à l'utilisation de RDCs, la courbure globale des structures en solution du dodécamère est réduite. Nous démontrons que cela résulte de la longue portée des contraintes RDCs et des propriétés de symétrie propres à un fragment auto-complémentaire d'ADN. Pour citer cet article : F. Alvarez-Salgado, et al., C.R. Chimie 7 (2004).
Mots clés : NMR ; DNA ; Dilute liquid crystals ; Residual dipolar couplings.
Mots clés : RMN ; ADN ; Cristaux liquides dilués ; Couplages résiduels dipolaires.
Plan
Vol 7 - N° 3-4
P. 259-263 - mars-avril 2004 Retour au numéro
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