QUASI : Quick Access to Spectral Interpretation - 01/01/04
Marie-Aude Coutouly, Bruno Kieffer, R. Andrew Atkinson * *Corresponding author.
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Résumé |
QUASI is a set of software tools that facilitate rapid interpretation of heteronuclear spectra of proteins. The first module establishes sequential connectivities semi-automatically using standard triple-resonance experiments (HNCA, HN(CO)CA, etc.). The result is a set of chain fragments for which the sequential assignment is unambiguous. The second module allows the chain fragments to be placed on the sequence by calculating a score reflecting agreement between experimental and theoretical parameters. The graphical interface of QUASI presents a concise view of the complete set of data, thus facilitating spectral interpretation. The use of QUASI is illustrated with two examples. To cite this article: M.-A. Coutouly et al., C. R. Chimie 7 (2004).
Résumé |
QUASI désigne un ensemble d'outils logiciels permettant de faciliter l'interprétation des spectres hétéronucléaires de protéines. Le premier module permet d'établir de façon semi-automatique les corrélations séquentielles à partir des spectres triple-résonance classiques (HNCA, HN(CO)CA, etc.). Le résultat est un ensemble de fragments pour lesquels une attribution séquentielle a pu être établie sans ambiguïté. Le deuxième module permet de placer ces fragments sur la séquence en calculant pour chaque position un facteur d'accord (score) entre les paramètres expérimentaux et théoriques. L'interface graphique de QUASI fournit une visualisation synthétique de l'ensemble des données, qui facilite l'exploitation et l'interprétation des spectres. L'application de QUASI est illustrée au moyen de deux exemples. Pour citer cet article : M.-A. Coutouly et al., C. R. Chimie 7 (2004).
Mots clés : NMR ; Protein ; Assignment ; Software.
Mots clés : RMN ; Protéine ; Attribution ; Logiciel.
Plan
Vol 7 - N° 3-4
P. 335-341 - mars-avril 2004 Retour au numéroBienvenue sur EM-consulte, la référence des professionnels de santé.
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