Caractérisation moléculaire des souches invasives d'Haemophilus influenzae isolées dans la région du Sahel tunisien - 01/01/05
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Résumé |
Cette étude a porté sur 25 souches d'Haemophilus influenzae isolées de cas de méningites et de septicémies chez des enfants âgés de moins de cinq ans hospitalisés dans les services pédiatriques de trois hôpitaux de la région du Sahel tunisien durant la période 1997–2002. Ces souches ont été biotypées et soumises à un typage capsulaire, par agglutination sur lame et réaction de polymérisation en chaîne (PCR), pour la détection du gène bexA et la détermination de sa spécificité. Le polymorphisme génétique de ces souches a été étudié en PCR aléatoire (AP-PCR) avec deux amorces différentes RAP IV et 217 δ2, ainsi qu'en électrophorèse en champ pulsé après digestion de l'ADN total avec l'enzyme de restriction SmaI (ECP SmaI). Dix-neuf souches parmi les 25 (76 %) étaient de biotype I. Le gène bexA a été mis en évidence chez 13 souches (52 %) et était dans tous les cas de type b. Douze souches étaient acapsulées. L'AP-PCR avec l'amorce RAP IV ayant généré 23 profils pour 25 souches (avec un indice de discrimination ID=0,993), s'est avérée aussi discriminante que l'électrophorèse en champ pulsé (20 profils pour 21 souches avec un ID=0,995). Nous constatons la meilleure sensibilité du typage capsulaire par PCR par rapport à l'agglutination sur lame, la diversité génétique des souches invasives et la fréquence élevée des souches acapsulées. L'AP-PCR avec l'amorce RAP IV est une alternative de choix par rapport à l'ECP pour le suivi épidémiologique des infections invasives à H. influenzae.
Le texte complet de cet article est disponible en PDF.Abstract |
We reported a molecular characterization of 25 Haemophilus influenzae strains derived from cases of meningitis and sepsis in children aged less than five years hospitalized in pediatric wards from three hospitals in the Sahel area (Tunisia) during the period 1997–2002. These strains were biotyped and subjected to a capsular typing by Slide agglutination serotyping and Polymerase Chain Reaction (PCR). The genetic polymorphism of these strains was also studied in Arbitrarily Primed Polymerase Chain Reaction (AP-PCR) with two sets of primers: RAP IV and 217 δ2 as in Pulsed Field Gel Electrophoresis after digestion of the total DNA with the restriction enzyme SmaI (PFGE SmaI). Nineteen strains among 25 (76%) were of biotype I. The bexA gene was highlighted in 13 strains (52%) and in all the cases it was of the type b. Twelve strains (48%) were shown to be unencapsulated by PCR. AP-PCR RAP IV (23 genotypes/25 with a discrimination index ID=0.993) had shown nearly the same discriminatory power than PFGE (20 genotypes/21 strains with a discrimination index ID=0.995). We thus note, how capsular typing by PCR is more sensitive than slide agglutination serotyping. We also note the genetic diversity of the invasive strains isolated with a remarkable presence of non typable strains. AP PCR seems to be an alternative of choice for the epidemiologic follow-up of the Haemophilus influenzae invasive infections.
Le texte complet de cet article est disponible en PDF.Mots clés : Diversité génétique, Electrophorèse en champ pulsé, Haemophilus influenzae, PCR aléatoire, Typage capsulaire
Keywords : Genetic diversity, Pulsed Field Gel Electrophoresis (PFGE), Haemophilus influenzae, Arbitrarily Primed Polymerase Chain Reaction (AP-PCR), Capsular typing, Tunisia
Plan
Vol 54 - N° 3
P. 137-147 - avril 2006 Retour au numéroBienvenue sur EM-consulte, la référence des professionnels de santé.
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