Virulence determinants, phylogenetic groups and fluoroquinolone resistance in Escherichia coli isolated from cystitis and pyelonephritis - 13/10/12
, M. Saidani a, S. Ennigrou b, M. Hsairi c, S. Ben Redjeb a
Corresponding author. Laboratoire de microbiologie, hôpital Charles-Nicolle de Tunis, boulevard 9-Avril, 1006 Tunis, Tunisia.Bienvenue sur EM-consulte, la référence des professionnels de santé.
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Abstract |
Aim of the study |
The aim of this study is to assess the relation between virulence genotype, phylogenetic group and susceptibility to fluoroquinolones and the urinary tract infection type including pyelonephritis and cystitis due to Escherichia coli.
Materials and methods |
Between 2006 and 2007, 129 non-duplicate E. coli isolates from pyelonephritis (n=56) and cystitis (n=73) were prospectively collected. The antibiotic susceptibility was done by disk diffusion method. The phylogenetic groups, A, B1, B2 and D and 18 virulence genes were determined by multiplex PCR. Statistical analysis was done with the Pearson χ2 test, Mann-Whitney U-test, Kruskal-Wallis test and stepwise multivariable logistic regression analysis, P values below 0.05 were considered statistically significant.
Results |
For the pyelonephritis group, sex ratio was 0.3, the median age for women was 30 years and for men it was 54 years. For the cystitis group, sex ratio was 0.4, the median age for women was 41.5 years and for men it was 67.8 years. Significant statistical correlations were found between pyelonephritis isolates and susceptibility to ciprofloxacin (P=4 10–5), papG allele II (P=2 10–6), hlyA (P=10–03), iroN (P=0.04), iha (P=0.03) and ompT (P=0.03) virulence genes, high virulence score (P=0.008) and B2 phylogenetic group (P=0.03). In multivariate logistic regression analysis, papG II as predictor of pyelonephritis, no correlation could be established for the cystitis group.
Conclusion |
Our findings argue for a direct link between pyelonephritis, virulence factors, susceptibility to fluroquinolones and B2 phylogenetic group among uropthogenic E. coli.
Le texte complet de cet article est disponible en PDF.Résumé |
But de travail |
L’objectif de ce travail est d’évaluer la relation entre facteurs de virulence, groupes phylogénétiques, résistance aux fluoroquinolones et le type d’infection urinaire à Escherichia coli.
Matériel et méthodes |
Entre 2006 et 2007, 129 souches non redondantes d’E. coli isolées de pyélonéphrites (n=56) et de cystites (n=73) ont été étudiées. La sensibilité aux antibiotiques a été faite par la méthode de diffusion en milieu gélosé. Les groupes phylogénétiques A, B1, B2 et D ainsi que 18 gènes de virulence ont été déterminés par PCR multiplex. L’étude statistique a été faite par les tests : χ2 de Pearson, U de Mann-Whitney, Kruskal-Wallis et l’analyse de régression logistique multivariée. La valeur de p<0,05 a été considérée statistiquement significative.
Résultats |
Pour les patients ayant présenté une pyélonéphrite, le sex-ratio était de 0,3. La moyenne d’âge était 30ans chez les femmes et 54ans chez les hommes. Pour les patients ayant présenté une cystite, le sex-ratio était de 0,4. La moyenne d’âge était 41,5ans chez les femmes et 67,8ans chez les hommes. Des corrélations statistiquement significatives ont été établies entre les souches isolées de pyélonéphrite et la sensibilité à la ciprofloxacine (p=4 10–5), les gènes : papG allele II (p=2 10–6), hlyA (p=10–3), iroN (p=0,04), iha (p=0,03) and ompT (p=0,03), un score de virulence élevé (p=0,008) et le groupe phylogénétique B2 (p=0,03). Aucune correlation statistique n’a été établie pour les souches isolées de cystite.
Conclusion |
Nos résultats confirment la relation entre pyélonéphrite, facteurs de virulence, sensibilité aux fluoroquinolones et l’appartenance au groupe phylogénétique B2 des souches d’E. coli uropathogène.
Le texte complet de cet article est disponible en PDF.Keywords : Uropathogenic Escherichia coli, Virulence genes, Urinary tract infection, Phylogenetic group, Fluoroquinolone resistance
Mots clés : Escherichia coli uropathogène, Gènes de virulence, Infection urinaire, Groupes phylogénétiques, Résistance aux fluoroquinolones
Plan
Vol 60 - N° 5
P. 270-274 - octobre 2012 Retour au numéro
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