La peau est le principal organe d'interface entre le milieu intérieur et l'environnement. Elle joue le rôle d'une barrière mécanique contre la pénétration des microorganismes pathogènes. Elle offre paradoxalement un milieu propice à la survie des germes commensaux qui forment un écosystème complexe anciennement appelé « flore cutanée ». La composition de cette microflore est la résultante d'un équilibre entre les conditions locales et les propriétés métaboliques de ces microorganismes. Le développement de nouvelles techniques de biologie moléculaire au cours des dernières années a permis de mieux caractériser cette population microbienne, en particulier bactérienne, et a révolutionné notre vision du monde microbiologique. Actuellement, le terme « flore cutanée » est remplacé par de nouvelles appellations, « microbiote » et « microbiome », deux termes distincts mais souvent confondus. Des études récentes montrent que le microbiote joue un rôle déterminant dans la fonction protectrice de la peau grâce à son activité antimicrobienne directe, et à sa capacité à induire et à moduler les réponses immunitaires. En contrepartie, une augmentation ou une réduction de la composition de ce microbiote, appelée communément « dysbiose », pourrait conduire ou du moins participer dans la physiopathologie de nombreux états pathologiques de la peau. Le microbiote cutané est ainsi le partenaire idéal du système immunitaire pour assurer l'homéostasie cutanée. L'étude de la relation étroite entre ce microbiote et l'immunité innée et adaptative représente aujourd'hui un champ de recherche extrêmement intéressant. Cette étude permettrait non seulement de mieux comprendre les mécanismes physiopathologiques de nombreuses dermatoses, mais également d'ouvrir des perspectives de manipulation du microbiote cutané à visée thérapeutique.