Les courants bidirectionnels utilisés sont sûrs, les effets indésirables sont rares. La performance des programmes dépend des caractéristiques du courant : la fréquence, la largeur d'impulsion et l'intensité. D'autres facteurs, comme la fréquence hebdomadaire d'application, le placement des électrodes, le cycle de travail, la tolérance du patient à la stimulation et son implication durant la séance sont aussi des éléments qui influencent le résultat. Les courants utilisés sont différents en fonction des objectifs à atteindre : dans un programme de renforcement musculaire, les fréquences utilisées sont habituellement comprises entre 35 et 100 Hz, tandis que, dans un programme à visée antalgique, elles sont inférieures à 10 Hz ou supérieures à 100 Hz. Le plus souvent, les courants excitomoteurs sont utilisés chez les patients qui ne peuvent réaliser la totalité d'un programme de réentraînement conventionnel. Il est important de souligner que ce type de programme ne peut remplacer un programme de réentraînement à l'effort standard, qui sollicite d'autres systèmes, en particulier cardiorespiratoires. L'électrostimulation antalgique est utilisée pour limiter la douleur chronique ou aiguë, qu'elle soit diffuse ou localisée. Quel qu'en soit l'objectif, des études supplémentaires contrôlées randomisées sont nécessaires pour définir les caractéristiques des programmes les plus efficaces.