La cytométrie de flux représente une étape essentielle dans le diagnostic et le suivi de la plupart des hémopathies malignes. Les cytomètres de flux actuellement disponibles permettent l'obtention de résultats rapides et fiables, avec d'une part des paramètres de taille et de structure des cellules, et d'autre part des paramètres de fluorescence spécifiques grâce à l'utilisation d'anticorps monoclonaux couplés à des fluorochromes. Le diagnostic de leucémie aiguë lymphoblastique ou myéloblastique repose sur l'analyse morphologique et l'immunophénotypage des cellules leucémiques dont certains marqueurs, seuls ou associés à des anomalies cytogénétiques, sont capables d'influencer le pronostic. L'intérêt de la cytométrie de flux est majeur dans le diagnostic des syndromes lymphoprolifératifs chroniques à dissémination sanguine, où l'immunophénotypage permet l'identification de la lignée en cause, B ou T, et très souvent une approche très précise du diagnostic. Cette technologie a été plus récemment appliquée à la classification des gammapathies monoclonales, en particulier le myélome multiple, où elle apporte des arguments intéressants pour le différencier des gammapathies monoclonales isolées ou de la maladie de Waldenström. Si elle reste encore facultative dans les myélodysplasies en dehors d'études protocolisées, elle représente en revanche, dans l'hémoglobinurie paroxystique nocturne, la seule technique qui permette aujourd'hui le diagnostic biologique. Enfin, dans la plupart des hémopathies qui peuvent bénéficier d'un traitement éradicateur, elle permet la quantification de la maladie résiduelle minimale et apporte ainsi aux cliniciens des arguments prédictifs de la rechute ou d'une longue survie. De plus, grâce aux avancées technologiques qu'elle continue à développer, elle représente un outil de choix pour mieux comprendre la physiopathologie des hémopathies malignes.