L'oncogenesi è determinata dalla comparsa di alterazioni genetiche specifiche, che possono portare alla superespressione di oncogeni o all'inattivazione di geni oncosoppressori. L'accumulo di tali alterazioni genetiche, che si manifestano in ordine definito, determina la progressione tumorale e permette di stabilire una classificazione molecolare dei tumori. Quest'ultima può permettere di distinguere profili genetici con prognosi diversa (in particolare, la perdita dei cromosomi 1p e 19q associata a prognosi favorevole negli oligodendrogliomi). Si discute sul ruolo delle alterazioni non genetiche (riattivazione dell'attività telomerasi che determina l'immmortalità cellulare, attivazione di cicli auto- o paracrini), come sui meccanismi dell'oncogenesi di meningiomi e schwannomi (inattivazione del gene NF2), ependimomi e medulloblastomi.

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