El lugar de la cirugía ha cambiado considerablemente en los últimos años, debido al desarrollo de nuevos tratamientos médicos eficaces. Sin embargo, más del 60% de los pacientes con enfermedad de Crohn se operan al menos una vez en la vida. Las decisiones quirúrgicas se toman en reuniones de concertación multidisciplinarias. Las indicaciones quirúrgicas se limitan al tratamiento de las complicaciones (estenosis, masas inflamatorias, perforaciones y fístulas sintomáticas) y de los fracasos del tratamiento médico. En la actualidad, el acceso laparoscópico es la vía de acceso de elección. La resección ileocecal es la intervención más utilizada para la enfermedad de Crohn del intestino delgado. El objetivo principal es la preservación intestinal. La resección debe limitarse a las lesiones macroscópicas responsables de la sintomatología. Las estricturoplastias se han propuesto como alternativa a la resección intestinal. Su indicación se plantea cuando la resección conlleva un riesgo de intestino corto (lesiones múltiples o recidiva reiterada). El colon se afecta en un 25% de los pacientes. El objetivo del tratamiento es retrasar la ileostomía definitiva. La colitis grave es la principal indicación quirúrgica de urgencia cuando existe una afectación colorrectal. El tratamiento consiste en una colectomía subtotal sin restablecimiento de la continuidad digestiva. Fuera de los casos urgentes, las indicaciones quirúrgicas son las colitis refractarias al tratamiento médico y las lesiones estenosantes sintomáticas o infranqueables por endoscopia. Las otras indicaciones son la presencia de una displasia o de un cáncer. Cuando no existe afectación rectal, o si es mínima, está justificado realizar una colectomía subtotal con anastomosis ileorrectal. En las otras situaciones (afectación grave, lesiones anoperineales que comprometan la función esfinteriana, incontinencia), la coloproctectomía con ileostomía terminal definitiva es la intervención de referencia. La alternativa a esta intervención, en pacientes seleccionados, es la coloproctectomía total con anastomosis ileoanal.