Si jadis la gastro-entéro-anastomose était pratiquée essentiellement en cas de sténose pyloroduodénale séquellaire de la maladie ulcéreuse, elle est de nos jours surtout indiquée en cas d'obstacle gastrique ou duodénal organique non réséquable, s'agissant alors le plus souvent d'une intervention palliative. Les progrès de la chirurgie mini-invasive permettent également d'effectuer cette intervention par voie coelioscopique de manière sûre et efficace. Cette technique a par ailleurs l'avantage de diminuer la douleur postopératoire et la durée d'hospitalisation, améliorant ainsi la qualité de vie chez des patients dont l'espérance de vie est souvent réduite.