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L’horloge circadienne et les rythmes transcriptomiques chez une espèce zooplanctonique clé pendant le jour polaire Arctique - 08/12/21

Doi : 10.1016/j.msom.2021.10.020 
Laura Payton 1, 2, , Lukas Hüppe 1, 2, 3, Céline Noirot 4, Claire Hoede 4, Kim Last 5, David Wilcockson 6, Elizaveta Ershova 7, 8, Sophie Valière 9, Bettina Meyer 1, 2, 3
1 Institute for Chemistry and Biology of the Marine Environment, Carl von Ossietzky University of Oldenburg, Oldenburg, 26111, Allemagne 
2 Section Polar Biological Oceanography, Alfred Wegener Institute Helmholtz Centre for Polar and Marine Research, Bremerhaven, 27570, Allemagne 
3 Helmholtz Institute for Functional Marine Biodiversity (HIFMB) at the University of Oldenburg, Oldenburg, 26111, Allemagne 
4 Plateforme bio-informatique GenoToul, MIAT, INRAE, UR875 Mathématiques et Informatique Appliquées Toulouse, 31326 Castanet-Tolosan, France 
5 Scottish Association for Marine Science, Oban, PA37 1QA Argyll, Royaume-Uni 
6 Institute of Biological, Environmental, and Rural Sciences, Aberystwyth University, SY23 3DA Aberystwyth, Royaume-Uni 
7 Department for Arctic and Marine Biology, Faculty for Biosciences, Fisheries and Economics, UiT The Arctic University of Norway, Tromsø, 9037, Norvège 
8 Shirshov Institute of Oceanology, Russian Academy of Sciences, 36, Nakhimova Avenue, Moscow, 117997, Russie 
9 Plateforme Génomique, INRAE US 1426 GeT-PlaGe, Centre INRAE de Toulouse Occitanie, 24, chemin de Borde Rouge - Auzeville, 31326 Castanet-Tolosan cedex, France 

Auteur correspondant.

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Résumé

Objectif

L’objectif de cette recherche est de découvrir si le fonctionnement de l’horloge circadienne et les rythmes transcriptomiques journaliers des organismes persistent pendant le jour polaire Arctique, quand le soleil est constamment au-dessus de l’horizon. Nous nous sommes focalisé sur le copépode Calanus finmarchicus, une espèce zooplanctonique avec une position clé dans la chaîne alimentaire et les cycles biogéochimiques.

Méthodes

Des prélèvements de copépodes ont été réalisés dans l’Océan Arctique (74,5°N et 82,5°N) au moment du solstice d’été, toutes les 4h pendant 24h. Les ARNm ont été extraits et séquencés (Illumina NovaSeq). Les gènes de l’horloge circadienne ont été analysés par PCR quantitative en temps réel. L’expression rythmique des gènes de l’horloge et du transcriptome (76 550 transcrits) a été testée grâce à l’algorithme RAIN.

Résultats

Il a pu être démontré pour la première fois que les rythmes d’expression des gènes de l’horloge circadienne et les rythmes transcriptomiques journaliers persistent pendant le jour polaire. De plus, à des latitudes extrêmement élevées et sous la banquise, les oscillations des gènes se réorganisent pour inclure des rythmes ultradiens, correspondant aux périodes des cycles de marées.

Conclusion

En période d’éclairement constant, des variations de faibles intensités lumineuses ou de qualité lumineuse sont suffisantes pour entraîner l’horloge circadienne et maintenir les processus biologiques journaliers chez cette espèce zooplanctonique clé. La synchronisation additionnelle par les cycles de marées illustre la plasticité de l’organisation temporelle chez les organismes marins. Ces travaux ont donné lieu à trois publications (rsbl.2020.0257, s41597-020-00751-4, j.isci.2020.101927).

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Vol 18 - N° 4

P. 192-193 - décembre 2021 Retour au numéro
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