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Tumor extrachromosomal DNA: Biogenesis and recent advances in the field - 27/04/24

Doi : 10.1016/j.biopha.2024.116588 
Haomin Wu, Shiqi Liu, Di Wu, Haonan Zhou, Gang Wu
 Department of General Surgery, the First Hospital of China Medical University, 155# Nanjing Street, Shenyang 110001, China 

Corresponding author.

Abstract

Extrachromosomal DNA (ecDNA) is a self-replicating circular DNA originating from the chromosomal genome and exists outside the chromosome. It contains specific gene sequences and non-coding regions that regulate transcription. Recent studies have demonstrated that ecDNA is present in various malignant tumors. Malignant tumor development and poor prognosis may depend on ecDNA's distinctive ring structure, which assists in amplifying oncogenes. During cell division, an uneven distribution of ecDNA significantly enhances tumor cells' heterogeneity, allowing tumor cells to adapt to changes in the tumor microenvironment and making them more resistant to treatments. The application of ecDNA as a cancer biomarker and therapeutic target holds great potential. This article examines the latest advancements in this area and discusses the potential clinical applications of ecDNA.

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Graphical Abstract




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Highlights

Proposed and explained all the possible models for ecDNA biogenesis.
Described the signaling pathways that involved in the regulation of ecDNA biogenesis.
Described the mechanism of ecDNA supporting tumor progression.
The prospect of ecDNA application for cancer therapy was explained.

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Abbreviations : DMs, EccDNA, SpcDNA, T-circles, EcDNA, BFB Cycle, HSR, MN, SOCS 1, APOBEC3, MHC, MTX, MSH3, DNA-PKi, DSB, DNA-PKCS, NRAS, ICD, FGFR2, MARS, EIFs, ALEMs

Keywords : ecDNA,tumor heterogeneity,drug resistance,biomarkers,genetics


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Vol 174

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