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Neonatal gut microbiota and risk of developing food sensitization and allergy - 01/03/25

Doi : 10.1016/j.jaci.2024.10.029 
Ryohei Shibata, MD, PhD a, b, c, , Yumiko Nakanishi, PhD a, b, Wataru Suda, PhD d, Taiji Nakano, MD, PhD e, Noriko Sato, MD, PhD e, Yosuke Inaba, PhD f, Yohei Kawasaki, PhD g, Masahira Hattori, PhD d, Naoki Shimojo, MD, PhD h, Hiroshi Ohno, MD, PhD a, b, d, i,
a Laboratorie for Intestinal Ecosystem, RIKEN Center for Integrative Medical Sciences, Yokohama, Japan 
d Laboratorie for Microbiome Sciences, RIKEN Center for Integrative Medical Sciences, Yokohama, Japan 
b Immunobiology Laboratory, Graduate School of Medical Life Science, Yokohama City University, Yokohama, Japan 
c Department of Pediatric Surgery, Graduate School of Medicine, Chiba University, Chiba City, Japan 
e Department of Pediatrics, Graduate School of Medicine, Chiba University, Chiba City, Japan 
h Center for Preventive Medical Sciences, Chiba University, Chiba City, Japan 
f Clinical Research Center, Chiba University Hospital, Chiba City, Japan 
g Faculty of Nursing, Japanese Red Cross College of Nursing, Tokyo, Japan 
i Intestinal Microbiota Project, Kanagawa Institute of Industrial Science and Technology, Kawasaki, Japan 

Corresponding authors: Hiroshi Ohno, MD, PhD, Laboratory for Intestinal Ecosystem, RIKEN Center for Integrative Medical Sciences, Yokohama, Kanagawa 230-0045, Japan.Laboratory for Intestinal EcosystemRIKEN Center for Integrative Medical SciencesYokohamaKanagawa230-0045JapanRyohei Shibata, MD, PhD, Laboratory for Intestinal Ecosystem, RIKEN Center for Integrative Medical Sciences, Yokohama, Japan. Or Department of Pediatric Surgery, Graduate School of Medicine, Chiba University, Chiba, Japan.Laboratory for Intestinal EcosystemRIKEN Center for Integrative Medical SciencesYokohamaJapan. Or Department of Pediatric SurgeryGraduate School of MedicineChiba UniversityChibaJapan

Abstract

Background

Food sensitization (FS) develops in early infancy and is a risk factor for subsequent food allergy (FA). Recent evidence suggests relationships of gut microbiota with FS and FA. However, little is known about the role of neonatal gut microbiota in the pathobiology of these manifestations.

Objectives

We sought to characterize gut microbiota in children using an enterotyping approach and determine the association of gut microbiota and the enterotypes with the development of FS and FA.

Methods

We combined gut microbiome and fecal short-chain fatty acid data from 2 longitudinal birth-cohort studies in Japan, clustered the microbiome data from children who were 1 week to 7 years old and their mothers and identified enterotypes. We also determined the associations of gut microbiota and enterotypes with risks of developing FS and FA across the 2 studies using multivariable regression models.

Results

Data from the 2563 microbiomes identified 6 enterotypes. More gut bacteria (eg, Bifidobacterium) in 1-month-old children showed significant relationships with the development of FS and FA than in 1-week-old children. Enterotypes at 1 month old consisted of Bacteroides-dominant, Klebsiella-dominant, and Bifidobacterium-dominant enterotypes. Bifidobacterium-dominant enterotypes with the highest fecal propionate concentration had the lowest risks of developing FS and FA, especially of hen egg white sensitization. Bifidobacterium-dominant enterotypes had lower risks at 2 years old in one study (vs Bacteroides-dominant enterotype, adjusted odds ratio [adjOR]: 0.10, 95% CI: 0.01-0.78; vs Klebsiella-dominant enterotype, adjOR: 0.10, 95% CI: 0.01-0.77) and at 9 months old in the other study (vs Bacteroides-dominant enterotype, adjOR: 0.33, 95% CI: 0.11-0.91).

Conclusions

In these birth-cohort studies, gut microbiome clustering identified distinct neonatal enterotypes with differential risks of developing FS and FA.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Key words : 16S rRNA gene sequencing, bifidobacterium, enterotype, food allergy, gut microbiota, hen egg white, neonate, propionate, sensitization, short-chain fatty acids

Abbreviations used : adjOR, CHIBA, DMM, HEW, rRNA, SCFA


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Vol 155 - N° 3

P. 932-946 - mars 2025 Retour au numéro
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