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Implémentation d’outils d’intelligence artificielle gratuits et développés en interne : expérience et cas d’usages dans un flux de pathologie numérique - 24/09/25

Implementation of free and in-house artificial intelligence tools: Experience and examples in a digital pathology workflow

Doi : 10.1016/j.annpat.2025.08.005 
Arnaud Uguen a, b, , Marion Le Rochais a, b, Glen Le Flahec a, Amelie Bourhis a, Anabelle Remoué a, Claire Bocciarelli a, Virginie Conan-Charlet a, Isabelle Quintin-Roué a, Laurent Doucet a, Pascale Marcorelles a
a CHU de Brest, service d’Anatomie et Cytologie Pathologiques, Brest F-29220, France 
b Université de Brest, Inserm, CHU de Brest, LBAI, UMR1227, Brest, France 

Auteur correspondant : Service d’Anatomie et Cytologie Pathologiques, CHU de Brest, hôpital Morvan, 5, avenue Foch, 29609 Brest, France.Service d’Anatomie et Cytologie Pathologiques, CHU de Brest, hôpital Morvan5, avenue FochBrest29609France
Sous presse. Épreuves corrigées par l'auteur. Disponible en ligne depuis le Wednesday 24 September 2025

Résumé

La pathologie numérique et les analyses d’images microscopiques par intelligence artificielle (IA) vont révolutionner les pratiques et le diagnostic en Anatomie et Cytologie Pathologiques. L’implémentation et l’utilisation des modèles d’IA en pratique de soin dans un flux de travail en pathologie numérique pose de nombreuses questions quant à la place de ces nouveaux outils. À côté de solutions logicielles commerciales, l’utilisation de logiciels gratuits et de modèles développés en interne peut être une stratégie intéressante. Elle peut favoriser l’appropriation de ces nouvelles technologies par les pathologistes tout en répondant à leurs besoins diagnostiques sans contrainte de flux de données ni de financement. La juste utilisation du juste modèle d’aide au diagnostic sous la critique constante du pathologiste responsable est une clé de l’intégration de l’IA en pratique de soin. Cet article présente une expérience d’implémentation d’outils d’IA gratuits et « maison » basée sur l’utilisation du logiciel QuPath et de ses extensions dans un flux de travail de pathologie numérique.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Summary

Digital pathology and microscopic image analysis using artificial intelligence (AI) will revolutionize practice and diagnosis in pathology. The implementation and use of AI models in clinical workflows within digital pathology raise numerous questions regarding the role of these new tools. Alongside commercial software solutions, the use of free software and “in-house” models can be an attractive strategy, promoting the adoption of these new technologies by pathologists while addressing their diagnostic needs without constraints related to data flow or funding. The appropriate use of the right diagnostic model – subject to the continuous scrutiny of the pathologist in charge  – is key to the integration of AI tools into clinical practice. This article presents an experience in implementing free and “in-house” AI tools based on the use of the QuPath software and its extensions within a digital pathology workflow.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Mots clés : Intelligence artificielle, Pathologie numérique, Classification, Segmentation, Quantification, QuPath

Keywords : Artificial intelligence, Digital pathology, Classification, Segmentation, Quantification, QuPath


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