Discovery of potential new drug targets for cystitis and chronic cystitis: a drug target Mendelian randomization study - 05/09/26
Découverte de nouvelles cibles médicamenteuses potentielles pour la cystite et la cystite chronique: une étude de randomisation mendélienne sur la cible médicamenteuse
, Yongxiang Shao 3, ⁎ Abstract |
Background: Acute cystitis is a common bacterial infection, and its progression to chronic forms poses significant challenges due to limitations of antibiotic therapy. We aimed to identify novel drug targets for cystitis using a Mendelian randomization approach.
Methods: We integrated plasma protein data (from DECODE and UKB-PPP) and eQTL data (from eqtlGEN) as exposures, with cystitis (FinnGEN) and chronic cystitis (LeeLab) data as outcomes. Analyses included MR, SMR, Bayesian colocalization, and HEIDI tests. Promising targets underwent druggability assessment, PheWAS, and PPI analysis.
Results: We identified eight potential targets for cystitis and one specific to chronic cystitis. Positive regulators included BTN3A2, H2BC5, HLA-DQA1, HLA-DQB1, and MARK3; negative regulators were TNXB, BTN2A1, and HLA-DQB2. MYCBPAP was a negative regulator specific to chronic cystitis. After validation, MARK3 and HLA-DQA1 were classified as Tier 2 (druggable), MYCBPAP as Tier 1, and others as Tier 3. PheWAS and PPI analyses indicated no major side effects or interactions for MARK3 and HLA-DQA1.
Conclusion: MARK3 and HLA-DQA1 are promising drug targets for cystitis. Inhibition of these proteins may offer therapeutic benefits. Further experimental validation is required. MYCBPAP represents a specific potential target for chronic cystitis, warranting future investigation.
Le texte complet de cet article est disponible en PDF.Abstract |
Le background: La cystite aiguë est une infection bactérienne courante, et sa progression vers des formes chroniques pose des défis importants en raison des limites de l'antibiothérapie. Nous avons cherché à identifier de nouvelles cibles médicamenteuses pour la cystite en utilisant une approche de randomisation mendélienne.
Méthodes: Nous avons intégré les données sur les protéines plasmatiques (de DECODE et UKB-PPP) et les données eQTL (de eqtlGEN) comme expositions, avec des données sur la cystite (FinnGEN) et la cystite chronique (LeeLab) comme résultats. Les analyses comprenaient des tests MR, SMR, colocalisation bayésienne et HEIDI. Les cibles prometteuses ont subi une évaluation de la pharmacocinéticité, une analyse PheWAS et PPI.
Résultats: Nous avons identifié huit cibles potentielles pour la cystite et une spécifique à la cystite chronique. Les régulateurs positifs comprenaient BTN3A2, H2BC5, HLA-DQA1, HLA-DQB1 et MARK3; les régulateurs négatifs étaient TNXB, BTN2A1 et HLA-DQB2. Le MYCBPAP était un régulateur négatif spécifique à la cystite chronique. Après validation, MARK3 et HLA-DQA1 ont été classés comme Tier 2 (médicamenteux), MYCBPAP comme Tier 1, et d'autres comme Tier 3. Les analyses PheWAS et PPI n'ont indiqué aucun effet secondaire majeur ou interaction pour MARK3 et HLA-DQA1.
Conclusion: MARK3 et HLA-DQA1 sont des cibles prometteuses pour la cystite. L'inhibition de ces protéines peut offrir des avantages thérapeutiques. Une validation expérimentale supplémentaire est nécessaire. Le MYCBPAP représente une cible potentielle spécifique pour la cystite chronique, justifiant des recherches futures.
Le texte complet de cet article est disponible en PDF.Keywords : drug target Mendelian randomization study, cystitis, chronic cystitis, quantitative trait loci
Abbreviations : IC, BPS, QTL, GWAS, MR, SMR, HEIDI test, pheWAS, PPI, SNP
Bienvenue sur EM-consulte, la référence des professionnels de santé.
L’accès au texte intégral de cet article nécessite un abonnement.
Déjà abonné à cette revue ?