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Exploring diversity of cultivable fungal communities in coastal sands and waters in south of France: impact of seasonality, and human activities - 03/11/26

Doi : 10.1016/j.mycmed.2026.101666 
Frédéric Roger a, ⁎ , Donika Krasteva a, Virginie Bellet a, Sylvie Randazzo a, Pascal Drakulovski a, Jean-Pierre Gangneux b, c, Esther Segal d, João Brandão e, f, Sébastien Bertout a
a UMI 233, TransVIHMI, UM-IRD-INSERM U1175, Laboratoire de Parasitologie Mycologie, Faculté de Pharmacie, Université de Montpellier, Montpellier, 34090, France 
b Université de Rennes, CHU Rennes, Inserm, EHESP, Irset (Institut de recherche en santé, environnement et travail) - UMR_S, 1085, Rennes, France 
c Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Centre National de Référence pour les aspergilloses chroniques (CNRMA-LA AspC), European Excellence Center in Medical Mycology (ECMM), Centre Hospitalier Universitaire de Rennes, Rennes, France 
d Department of Clinical Microbiology and Immunology, Faculty of Medicine, Tel Aviv University, Tel Aviv, Israel 
e Department of Environmental Health, National Institute of Health Dr. Ricardo Jorge, Lisbon, Portugal 
f CE3C – Centre for Ecology, Evolution and Environmental Changes, Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, Campo Grande 016, 1749-016, Lisboa, Portugal 

⁎ Corresponding author.

Highlights

•
Fungal abundance peaked in fall, lowest in winter.
•
Filamentous fungi dominate but yeasts are more resilient to cold.
•
Urban beaches showed more fungi, influenced by human activity.
•
Acremonium-like species were highly prevalent.
•
No dermatophytes were detected in any of the cultivable samples.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Abstract

WHO guidelines emphasize the need for fungal studies in recreational waters. In this context, the MYCOSAND project was launched to assess fungal communities in sand and coastal water. This study focuses on the Mediterranean coast near to Montpellier (France) and provides a one-year seasonal survey across twelve beaches with different levels of urbanization. While previous research has focused on fecal indicator bacteria (FIB), recent findings suggest that this focus may be insufficient, given emerging concerns about antimicrobial resistance and the possible role of fungal communities.

A total of 799 fungal colonies were isolated from 96 samples. Fungal abundance showed marked seasonal variation, with a peak in fall (406 CFUs) and a minimum in winter (80 CFUs), and these differences were statistically significant (Chi-square test, p <  0.05). Filamentous fungi dominated (approximately 80% of isolates), including Aspergillus (14.1%), Penicillium (5.6%) and Fusarium (3.8%), while yeasts (13%) included Candida -like (5.3%) and Rhodotorula -like species (3.6%). Notably, an unusually high prevalence of Acremonium -like isolates was observed (n = 231), representing the most abundant genus, which contrasts with previous studies. Surprisingly, dermatophytes were absent.

Our results suggest an influence of climatic drivers on fungal communities and are consistent with findings from other studies conducted in coastal regions. Given the rising concerns about antifungal resistance, future research should assess fungal resistance patterns. This study highlights the importance of continued monitoring of fungal communities in coastal environments. To our knowledge, this study represents the first year-long survey of cultivable fungal communities in beach sand and bathing waters along the Mediterranean coast of southern France.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : Seasonality, Health risk, Fungal communities, Yeast and filamentous pathogens, Coastal environment


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Vol 36 - N° 4

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