Médecine

Paramédical

Autres domaines


S'abonner

Species identification and strain differentiation of dermatophyte fungi using polymerase chain reaction amplification and restriction enzyme analysis - 29/08/11

Doi : 10.1067/mjd.2003.491 
Jang-Hyun Shin, MDa, Jung-Hyun Sung, MSb, Sang-Jin Park, MDa, Jeong Aee Kim, MD, PhDc, Joo-Heung Lee, MD, PhDa, Dong-Youn Lee, MDa, Eil-Soo Lee, MD, PhDa, Jun-Mo Yang, MD, PhDa,b
Seoul, Korea 
From the Department of Dermatology, Samsung Medical Center, Sungkyunkwan University School of Medicinea; Samsung Biomedical Research Instituteb; and Department of Dermatology, Seoul National University College of Medicinec 

Abstract

Background: Standard biochemical tests, microscopy, colony characteristics, and mating tests have conventionally been used for the identification of dermatophytes species, but these methods of identification are costly, time-consuming, and require special skills. Objective: Our purpose was to identify a method that enables rapid species identification and strain differentiation of dermatophyte fungi. Methods: We chose 4 restriction enzymes (BsYiI, DdeI, HinfI, and MvaI) that could produce different fragment patterns after enzyme digestion according to species or strain. We performed enzyme digestions after polymerase chain reaction amplification of internal transcribed spacer region and identified different restriction fragment length polymorphisms (RFLP) according to species and strains. Results: All the species included in this study could be easily differentiated using any combination of 2 different restriction enzymes except Trichophyton rubrum and T raubitschekii, which produced identical digestion patterns after all 4 restriction enzyme digestions. In the case of T mentagrophytes, MvaI and DdeI each produced 2 distinct RFLP patterns. Conclusion: This study showed that internal transcribed spacer region analysis using polymerase chain reaction-RFLP through DdeI and MvaI is useful for rapid identification of the majority of dermatophytes species. However, there were 2 different band patterns by DdeI and MvaI restriction enzyme digestion and no correlations between morphologic types and RFLP patterns in T mentagrophytes. (J Am Acad Dermatol 2003;48:857-65.)

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Abbreviations : ITS, PCR, RFLP


Plan


 Supported by a grant (01-PJ3-PG6-01GN12-0001) of the 2001 Good Health R and D Project, Ministry of Health and Welfare, Republic of Korea (Yang).
☆☆ Conflict of interest: None identified.
 Reprint requests: Jun-Mo Yang, MD, PhD, Department of Dermatology, Samsung Medical Center, Sungkyunkwan University School of Medicine, 50 Ilwon-Dong Kangnam-Gu, Seoul 135-230, Korea. E-mail: jmyangsmc@samsung.co.kr.
★★ 0190-9622/2003/$30.00 + 0


© 2003  American Academy of Dermatology, Inc. Publié par Elsevier Masson SAS. Tous droits réservés.
Ajouter à ma bibliothèque Retirer de ma bibliothèque Imprimer
Export

    Export citations

  • Fichier

  • Contenu

Vol 48 - N° 6

P. 857-865 - juin 2003 Retour au numéro
Article précédent Article précédent
  • Scytalidiosis in Paris, France
  • Claire Lacroix, Guillaume Kac, Louis Dubertret, Patrice Morel, Francis Derouin, Martine Feuilhade de Chauvin
| Article suivant Article suivant
  • UV photoprotection by combination topical antioxidants vitamin C and vitamin E
  • Jing-Yi Lin, M.Angelica Selim, Christopher R. Shea, James M. Grichnik, Mostafa M. Omar, Nancy A. Monteiro-Riviere, Sheldon R. Pinnell

Bienvenue sur EM-consulte, la référence des professionnels de santé.
L’accès au texte intégral de cet article nécessite un abonnement.

Déjà abonné à cette revue ?

Mon compte


Plateformes Elsevier Masson

Déclaration CNIL

EM-CONSULTE.COM est déclaré à la CNIL, déclaration n° 1286925.

En application de la loi nº78-17 du 6 janvier 1978 relative à l'informatique, aux fichiers et aux libertés, vous disposez des droits d'opposition (art.26 de la loi), d'accès (art.34 à 38 de la loi), et de rectification (art.36 de la loi) des données vous concernant. Ainsi, vous pouvez exiger que soient rectifiées, complétées, clarifiées, mises à jour ou effacées les informations vous concernant qui sont inexactes, incomplètes, équivoques, périmées ou dont la collecte ou l'utilisation ou la conservation est interdite.
Les informations personnelles concernant les visiteurs de notre site, y compris leur identité, sont confidentielles.
Le responsable du site s'engage sur l'honneur à respecter les conditions légales de confidentialité applicables en France et à ne pas divulguer ces informations à des tiers.