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3D geometric morphometrics and missing-data. Can extant taxa give clues for the analysis of fossil primates? - 25/11/10

Morphométrie géométrique 3D et données manquantes. Les taxons actuels peuvent-ils nous donner des indications pour étudier les primates fossiles ?

Doi : 10.1016/j.crpv.2010.07.002 
Sébastien Couette a, , Jess White b
a UMR CNRS 7207 “CR2P”, département histoire de la Terre, école pratique des hautes études, Muséum national d’histoire naturelle, CP 38, 8, rue Buffon, 75005 Paris, France 
b Department of Sociology and Anthropology, Functional Morphology and Evolutionary Anatomy Working Group, 404 Morgan Hall, Western Illinois University, Macomb, Illinois 61455 USA 

Corresponding author.

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Written on invitation of the Editorial Board

Abstract

Geometric morphometric methods constitute a powerful and precise tool for the quantification of morphological differences. The use of geometric morphometrics in palaeontology is very often limited by missing data. Shape analysis methods based on landmarks are very sensible but until now have not been adapted to this kind of dataset. To analyze the prospective utility of this method for fossil taxa, we propose a model based on prosimian cranial morphology in which we test two methods of missing data reconstruction. These consist of generating missing-data in a dataset (by increments of five percent) and estimating missing data using two multivariate methods. Estimates were found to constitute a useful tool for the analysis of partial datasets (to a certain extent). These results are promising for future studies of morphological variation in fossil taxa.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Résumé

Les méthodes de morphométrie géométrique constituent un outil puissant et précis dans la quantification des différences morphologiques. Cependant, l’application des méthodes de morphométrie géométriques en paléontologie soulève le problème des données manquantes. Le matériel étant souvent fragmentaire, les méthodes d’analyse de forme, et notamment les méthodes faisant appel aux points homologues, sont inadaptées à ce type de données. Dans une perspective d’application aux fossiles, un modèle de test des méthodes de reconstruction des données manquantes est proposé sur un échantillon de primates prosimiens. Ce modèle consiste à générer des données manquantes à partir d’un jeu de données complet (par tranche de 5 %) et de reconstruire ces données manquantes. La pertinence des reconstructions est testée. Les résultats indiquent que, dans une certaine limite, les méthodes de reconstruction permettent d’inclure dans l’analyse les spécimens dont la préservation est partielle. Ces conclusions sont prometteuses pour l’analyse de la variation morphologique des taxons fossiles.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : Missing-data, Morphometrics, Estimation, Landmarks

Mots clés : Données manquantes, Morphométrie, Estimation, Points homologues


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Vol 9 - N° 6-7

P. 423-433 - septembre 2010 Retour au numéro
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  • Two applications of 3D semi-landmark morphometrics implying different template designs: the theropod pelvis and the shrew skull
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  • Calvarial shape variation among Middle Pleistocene hominins: An application of surface scanning in palaeoanthropology
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