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Vers une meilleure détection du signal et gestion des connaissances en pharmacovigilance : le projet VigiTermes - 30/03/11

Towards a better signal detection and knowledge management in pharmacovigilance: The VigiTermes project

Doi : 10.1016/j.irbm.2011.01.037 
C. Bousquet a, , b , F. Amardheil c, J.-M. Daube d, D. Delamarre e, C. Duclos f, S.-G. Lanne g, M.-C. Jaulent b, A. Lillo-Le Louët h, Y. Toussaint i
a Département de santé publique et information médicale, université de Saint-Étienne, batiment CIM 42, hôpital Nord, chemin de la Marandière, 42055 Saint-Étienne, France 
b Inserm, UMR_S 872, eq.20, université Paris-Descartes, 75006 Paris, France 
c Mondeca, 75018 Paris, France 
d Centre de recherche en ingénierie multilingue, institut national des langues et civilisations orientales, 75012 Paris, France 
e Inserm U936, université Rennes 1, IFR 140, 35033 Rennes, France 
f Laboratoire d’informatique médicale & bioinformatique, université Paris 13, UFR de santé médecine et biologie humaine, 93017 Bobigny, France 
g Temis, 75001 Paris, France 
h Centre régional de pharmacovigilance, hôpital européen Georges-Pompidou, AP–HP, 75015 Paris, France 
i LORIA–INRIA Nancy Grand-Est, 54506 Vandœuvre-lès-Nancy, France 

Auteur correspondant.

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Résumé

Objectifs

La prévention des effets indésirables liés aux médicaments (EIM) est devenue un important enjeu de santé publique. La pharmacovigilance a pour objet l’identification, l’analyse et la prévention des risques liés aux EIM. L’objectif du projet VigiTermes est de développer des méthodes innovantes pour une détection plus précoce des EIM.

Matériel et méthodes

Les méthodes mises en œuvre appartiennent à l’ingénierie des connaissances, l’ingénierie multilingue, le traitement automatique du langage et à la fouille de texte.

Résultats

Le principal résultat du projet est la mise en place d’une architecture logicielle destinée à la recherche et l’analyse des articles décrivant les EIM sur le serveur bibliographique PubMed. Il s’agit de la première application de ce type destinée à la pharmacovigilance. Les autres résultats sont en rapport avec la détection statistique des signaux, la modélisation des médicaments et des EIM au moyen d’ontologies, la recherche d’information dans les bases de données de pharmacovigilance et l’application de méthode de traitement automatique des langues en japonais appliquée à des cas de pharmacovigilance.

Discussion

Des développements sont en cours afin de mettre les résultats du projet sous forme opérationnelle pour une exploitation par les autorités réglementaires et les laboratoires pharmaceutiques. L’amélioration de l’interface graphique devrait faciliter l’aide à la décision pour les professionnels responsables des questions liées à la pharmacovigilance.

Conclusion

Notre ambition est de continuer l’intégration des composants sur la plateforme commune afin de proposer aux pharmacovigilants l’outil le plus complet et le plus efficace pour la détection, ainsi que le suivi et la consolidation des signaux de pharmacovigilance.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Abstract

Objectives

Prevention of adverse drug reactions (ADRs) has become an important public health issue. Pharmacovigilance is dedicated to the identification, analysis and prevention of risks related to ADRs. The objective of the VigiTerms project is to develop innovative methods for earlier detection of ADRs.

Material and methods

We used methods related to knowledge engineering, multi lingual engineering, natural language processing and text mining.

Results

The main result of the project is a software architecture for search and analysis of articles describing ADRs on the PubMed server. This is the first implementation of such an application for pharmacovigilance. Other results are related to statistical signal detection, modelling of drugs and ADRs with ontologies, information retrieval in pharmacovigilance databases and natural language processing applied to case reports in Japanese.

Discussion

Developments are underway to make the results of the project in operational form for use by regulatory authorities and pharmaceutical companies. Improved graphical user interface should facilitate decision support for professionals in charge of pharmacovigilance issues.

Conclusion

Our ambition is to continue the integration of components on the common platform to offer pharmacovigilance teams the most complete and effective tools for detecting, tracking and consolidation of pharmacovigilance signals.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Mots clés : Pharmacovigilance, Recherche bibliographique, Détection du signal, Ontologie, Traitement automatique du langage

Keywords : Pharmacovigilance, Information retrieval, Signal detection, Ontology, Natural language processing


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Vol 32 - N° 2

P. 158-161 - avril 2011 Retour au numéro
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