La maladie de Crohn se complique fréquemment d'une atteinte anopérinéale dont l'incidence est diversement appréciée dans la littérature. Sa présence constitue toujours une complication grave, car le retentissement sur la qualité de vie est important. À côté des lésions inflammatoires diffuses et de la lésion primaire qu'est l'ulcération, il faut identifier les complications secondaires, de traitement mixte, médicochirurgical. Le chirurgien intervient en urgence pour évacuer un abcès et le plus souvent installer un drainage en séton, lorsqu'une fistulotomie ferait porter un risque trop important d'incontinence par section du sphincter. Il peut également intervenir devant des complications chroniques. La fistule anorectale peut être traitée par drainage en séton prolongé lorsque le trajet est haut situé, ou par fistulotomie lorsque le trajet est transsphinctérien bas ou sous-cutané. Les récidives nécessitent souvent un avis spécialisé, car il faut poser l'indication de la meilleure technique selon divers critères, comme le degré d'inflammation, le siège des orifices, le trajet de la fistule, la qualité du sphincter, le nombre de fistules et l'association éventuelle à une sténose plus ou moins longue. Plusieurs méthodes chirurgicales sont disponibles pour traiter une fistule asséchée : lambeau d'abaissement rectal, injection de colle biologique, insertion d'un plug, ligature intersphinctérienne du trajet fistuleux, pose d'un clip, injection de cellules mésenchymateuses autologues ou non, réalisation d'un lambeau de Martius ou de gracilis. Une sténose anorectale nécessite des dilatations répétées et, en cas de récidive, une plastie dont l'indication est là encore affaire de spécialiste. Dans certains cas de maladie de Crohn évoluée, il faut savoir proposer au patient une stomie temporaire, voire définitive lorsque les lésions sont jugées sévères et irréversibles. Le caractère chronique et invalidant de l'affection ainsi que la multiplicité des traitements proposés pour une même lésion doivent faire intervenir le patient dans la prise en charge, de toute façon médicochirurgicale, puisque plusieurs solutions s'offrent le plus souvent à lui, avec une efficacité, des complications et des séquelles variables.