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A novel BRCA2 in frame deletion in a Tunisian woman with early onset sporadic breast cancer - 18/09/15

Doi : 10.1016/j.patbio.2015.07.009 
N. Hadiji-Abbes a, 1, F. Trifa a, 1, M. Choura a, A. Khabir b, T. Sellami-Boudawara b, M. Frikha b, J. Daoud b, R. Mokdad-Gargouri a,
a Center of Biotechnology of Sfax, University of Sfax, BP K 3018, Sfax, Tunisia 
b Departement of Anatomoapathology, Oncology and Radiotherapy of Habib Bourguiba Hospital, Sfax, Tunisia 

Corresponding author at: CBS route Sidi Mansour Km 6, BP 1177, 3018 Sfax, Tunisia.

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Abstract

Background

Breast cancer is increasing among young women in Tunisia. Germline mutations in the BRCA1/2 genes are associated with a high risk for breast cancer development. However, the true contribution of BRCA1/2 mutation in sporadic breast cancer is not well documented. Our aim is to identify the BRCA2 mutation spectrum in Tunisian young women with breast cancer.

Methods

Screening the BRCA2 gene was performed using DHPLC, DNA sequencing and PCR-RFLP.

Results

We identified, in a woman diagnosed with early onset breast cancer, and without family history, a novel in frame deletion 5456delGTAGCA in the exon 11 of the BRCA2 gene which causes a loss of two residues Ser1743-Ser1744. The absence of this deletion in the patients’ parents suggests that it is a de novo variant. Furthermore, we screened 108 sporadic cases, 50 familial cases, and 60 controls for the identified del6bp using PCR-RFLP. None of them carried this deletion suggesting that this variant is not a benign polymorphism and probably rare in our population. With regards to the position of the Ser1743-1744 in the BRCT domain, sequence alignment revealed that the Ser1743 is conserved among several species, which may reflect its importance in the BRCA2 function. A modeling of the wild-type and mutated BRC5-BRC6 domain revealed that the deletion of the 2 Serine residues might affect the structure of this BRCA2 domain.

Conclusions

A novel in frame deletion 5456del6bp in BRCA2 gene was identified in an early onset woman with breast cancer and without family history.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Résumé

Introduction

Le cancer du sein chez la femme jeune est de plus en plus fréquent en Tunisie. Les mutations germinales touchant les gènes BRCA1/2 sont associées à une augmentation du risque de développer un cancer du sein. Cependant, la contribution des mutations BRCA1/2 dans la forme sporadique n’est pas bien documentée. L’objectif de notre étude est d’identifier les mutations du gène BRCA2 chez les jeunes femmes tunisiennes ayant un cancer du sein.

Méthodes

La recherche de mutation dans le gène BRCA2 a été réalisée par PCR-DHPLC, séquençage de l’ADN et PCR-RFLP.

Résultats

Nous avons identifié chez une jeune femme diagnostiquée avec un cancer du sein sans histoire familiale, une nouvelle délétion de 6pb « 5456delGTAGCA » dans l’exon 11 du gène BRCA2 entraînant la perte de 2 résidus Ser1743-Ser1744. L’absence de cette délétion chez les 2 parents de la patiente suggère qu’il s’agit d’un variant « de novo ». D’autre part, nous avons analysé par PCR-RFLP, l’ADN de 108 patientes avec la forme sporadique et de 50 patientes avec la forme familiale du cancer du sein en plus de 60 témoins. Aucune d’entre elles ne portait le variant del6pb suggérant qu’il ne s’agirait pas d’un polymorphisme, d’une part, et, d’autre part, que ce variant est rare dans notre population. Vue la position des Ser1743-1744 dans le domaine BRCT, l’alignement de séquences a montré que la Ser1743 est conservée parmi différentes espèces, ce qui pourrait refléter son importance fonctionnelle. De plus, la modélisation des domaines BRC5-BRC6 sauvages et mutés a révélé que la délétion aurait un impact sur la structure de ce domaine de BRCA2.

Conclusions

Une nouvelle deletion de 6pb « 5456del6bp » dans le gène BRCA2 a été identifiée chez une jeune patiente diagnostiquée avec un cancer du sein sans histoire familiale.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : Sporadic breast cancer, BRCA2, Mutation screening, In frame deletion

Mots clés : Cancer du sein sporadique, BRCA2, Recherche de mutation, Délétion en phase


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Vol 63 - N° 4-5

P. 185-189 - septembre 2015 Retour au numéro
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