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Near real-time space-time cluster analysis for detection of enteric disease outbreaks in a community setting - 10/07/16

Doi : 10.1016/j.jinf.2016.04.038 
Aharona Glatman-Freedman a, b, c, ⁎ , Zalman Kaufman a, Eran Kopel d, Ravit Bassal a, Diana Taran e, Lea Valinsky f, Vered Agmon f, Manor Shpriz d, Daniel Cohen g, Emilia Anis d, Tamy Shohat a, g
a Infectious Diseases Unit, Israel Center for Disease Control, Tel-Hashomer, Israel 
b Department of Pediatrics, New York Medical College, Valhalla, NY, USA 
c Department of Family and Community Medicine, New York Medical College, Valhalla, NY, USA 
d Division of Epidemiology, Ministry of Health, Jerusalem, Israel 
e Maccabi Healthcare Services, Tel-Aviv, Israel 
f Government Central Laboratories, Ministry of Health, Jerusalem, Israel 
g School of Public Health, Sackler Faculty of Medicine, Tel Aviv University, Tel-Aviv, Israel 

∗Corresponding author. Infectious Diseases Unit, Israel Center for Disease Control, Tel-Hashomer, Israel. Tel.: +972 3 7371500; fax: +972 2 5655994.Infectious Diseases UnitIsrael Center for Disease ControlTel-HashomerIsrael

Summary

Objectives

To enhance timely surveillance of bacterial enteric pathogens, space-time cluster analysis was introduced in Israel in May 2013.

Methods

Stool isolation data of Salmonella, Shigella, and Campylobacter from patients of a large Health Maintenance Organization were analyzed weekly by ArcGIS and SaTScan, and cluster results were sent promptly to local departments of health (LDOHs).

Results

During eighteen months, we identified 52 Shigella sonnei clusters, two Salmonella clusters, and no Campylobacter clusters. S. sonnei clusters lasted from one to 33 days and included three to 30 individuals. Thirty-one (60%) of the S. sonnei clusters were known to LDOHs prior to cluster analysis. Clusters not previously known by the LDOHs prompted epidemiologic investigations. In 31 of the 37 (84%) confirmed clusters, educational institutes (nursery schools, kindergartens, and a primary school) were involved.

Conclusions

Cluster analysis demonstrated capability to complement enteric disease surveillance. Scaling up the system can further enhance timely detection and control of outbreaks.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : Cluster analysis, Public health, Enteric pathogens, Outbreak detection, Geographical information system (GIS)


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Vol 73 - N° 2

P. 99-106 - août 2016 Retour au numéro
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  • Low-grade endotoxemia, gut permeability and platelet activation in community-acquired pneumonia
  • Roberto Cangemi, Pasquale Pignatelli, Roberto Carnevale, Simona Bartimoccia, Cristina Nocella, Marco Falcone, Gloria Taliani, Francesco Violi

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