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Why so GLUMM? Detecting depression clusters through graphing lifestyle-environs using machine-learning methods (GLUMM) - 10/01/17

Doi : 10.1016/j.eurpsy.2016.06.003 
J.F. Dipnall a, b, , J.A. Pasco a, c, d, e, 1, M. Berk a, e, f, g, h, 1, L.J. Williams a, 1, S. Dodd a, e, f, 1, F.N. Jacka a, f, i, j, 1, D. Meyer b, 1
a Impact strategic research centre, school of medicine, Deakin university, PO Box 281, Geelong, Victoria 3220, Australia 
b Department of statistics, data science and epidemiology, Swinburne university of technology, Swinburne, Australia 
c Melbourne clinical school-western campus, the university of Melbourne, Saint-Albans, VIC, Australia 
d Department of epidemiology and preventive medicine, Monash university, Melbourne, VIC, Australia 
e University hospital of Geelong, Geelong, VIC, Australia 
f Department of psychiatry, the university of Melbourne, Parkville, VIC, Australia 
g Florey institute of neuroscience and mental health, Parkville, VIC, Australia 
h Orygen, the National centre of excellence in youth mental health, Parkville, VIC, Australia 
i Centre for adolescent health, Murdoch children's research institute, Melbourne, Australia 
j Black Dog institute, Sydney, Australia 

Corresponding author. Impact strategic research centre, school of medicine, Deakin university, PO Box 281, Geelong, Victoria 3220, Australia.

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Abstract

Background

Key lifestyle-environ risk factors are operative for depression, but it is unclear how risk factors cluster. Machine-learning (ML) algorithms exist that learn, extract, identify and map underlying patterns to identify groupings of depressed individuals without constraints. The aim of this research was to use a large epidemiological study to identify and characterise depression clusters through “Graphing lifestyle-environs using machine-learning methods” (GLUMM).

Methods

Two ML algorithms were implemented: unsupervised Self-organised mapping (SOM) to create GLUMM clusters and a supervised boosted regression algorithm to describe clusters. Ninety-six “lifestyle-environ” variables were used from the National health and nutrition examination study (2009–2010). Multivariate logistic regression validated clusters and controlled for possible sociodemographic confounders.

Results

The SOM identified two GLUMM cluster solutions. These solutions contained one dominant depressed cluster (GLUMM5-1, GLUMM7-1). Equal proportions of members in each cluster rated as highly depressed (17%). Alcohol consumption and demographics validated clusters. Boosted regression identified GLUMM5-1 as more informative than GLUMM7-1. Members were more likely to: have problems sleeping; unhealthy eating; ≤2 years in their home; an old home; perceive themselves underweight; exposed to work fumes; experienced sex at ≤14 years; not perform moderate recreational activities. A positive relationship between GLUMM5-1 (OR: 7.50, P<0.001) and GLUMM7-1 (OR: 7.88, P<0.001) with depression was found, with significant interactions with those married/living with partner (P=0.001).

Conclusion

Using ML based GLUMM to form ordered depressive clusters from multitudinous lifestyle-environ variables enabled a deeper exploration of the heterogeneous data to uncover better understandings into relationships between the complex mental health factors.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : Depression, Psychiatry, Machine learning, Boosted regression, Cluster, Lifestyle

Abbreviations : DIPIT, GLUMM, GLUMM5-1, GLUMM5-2, GLUMM7-1, GLUMM7-3, GLUMM7-4, ML, MART, NCHS, NHANES, PHQ-9, SOMs


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