Salvo algunas excepciones como Trichomonas, los parásitos rara vez tienen una localización urogenital exclusiva. Sin embargo, entre las esquistosomiasis de localización hepática e intestinal, la forma urogenital es muy frecuente en África subsahariana y se manifiesta por hematuria. La hidatidosis se localiza sobre todo en el hígado o los pulmones, pero también son posibles las localizaciones renales. Otras parasitosis (filariosis, paludismo) provocan glomerulonefritis por reacciones inmunitarias que desaparecen con el tratamiento específico del parásito responsable. La localización genitourinaria de las demás parasitosis es mucho más infrecuente.