Le complexe Candida parapsilosis : étude moléculaire des souches isolées au CHU Sfax, Tunisie - 16/09/17
Résumé |
Actuellement, le complexe Candida parapsilosis est composé grâce à la biologie moléculaire de trois espèces phénotypiquement identiques et génotypiquement différentes : C. parapsilosis sensu stricto, Candida orthopsilosis et Candida metapsilosis. En Tunisie, les données relatives à ce complexe sont limitées. Ainsi, le but de notre étude était de déterminer par la PCR-RFLP du gène SADH et le séquençage des régions ITS, la répartition des espèces au sein de ce complexe chez 182 isolats identifiés comme C. parapsilosis par des méthodes phénotypiques.
Après amplification par les amorces S1F et S1R du gène SADH, des bandes de taille de 717 pb ont été révélées par gel d’agarose. Après la digestion par l’enzyme de restriction Ban I, nous avons obtenu 3 profils : A (196 et 521 pb) pour 172 souches, B (375, 189, 93 et 60 pb) pour 6 souches et C (717 pb) pour 4 souches. Ces profils correspondaient respectivement à C. parapsilosis sensu stricto, C. metapsilosis et C. orthopsilosis.
Une PCR-séquençage des régions de l’ADN ribosomal, réalisée pour 52 souches, a permis de confirmer les résultats de la PCR-RFLP. Pour les 42 souches de C. parapsilosis sensu stricto, un seul type de séquence ITS (KT948326) était observé. Pour les 6 souches de C. metapsilosis, trois types de séquences ITS ont été observés et déposés dans la base de données GenBank sous les numéros d’accession : KU665248, KU665249, KU665250, KU665251, KX421284 et KU665252. Pour les 4 souches de C. orthopsilosis, deux types de séquences ITS étaient détectés et déposés dans la base de données GenBank sous les numéros d’accession : KU665253, KU665254, KU665255, et KU665256. Pas de corrélation statistiquement significative était observée entre le type de séquence ITS et le site d’infection pour C. metapsilosis et C. orthopsilosis.
La répartition des espèces au sein de ce complexe était : 94,5 % de C. parapsilosis sensu stricto, 3,3 % de C. metapsilosis et 2,2 % de C. orthopsilosis.
La PCR-RFLP était capable d’identifier et de différencier les espèces du complexe C. parapsilosis. Cette méthode est devenue la technique de référence et classique dans de telles études. C. orthopsilosis semble être le plus hétérogène des espèces « psilosis ». Cette surveillance de notre épidémiologie locale s’avère nécessaire vue les différences sur le plan virulence et sensibilité aux antifongiques de ces trois espèces, pouvant avoir d’importantes implications cliniques et thérapeutiques.
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Vol 27 - N° 3
P. e29 - septembre 2017 Retour au numéroBienvenue sur EM-consulte, la référence des professionnels de santé.
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