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Évolution des outils informatiques d’analyse des données en cytométrie en flux - 14/12/17

Doi : 10.1016/S1773-035X(17)30323-4 
Francis Lacombe a, Marc Maynadié b, Bernard Chatelain c, Marie-Christine Béné d,
a Laboratoire de cytométrie, Hématologie biologique, Hôpital Haut Levêque, CHU de Bordeaux, Avenue de Magellan - 33604 Pessac Cedex - France 
b Hématologie biologique, Pôle Laboratoires, CHU de Dijon, 2, rue Angélique Ducoudray, BP 37013 - 21070 Dijon Cedex - France 
c Hématologie biologique, Hôpital Mont Godinne, 1, avenue G. Thérasse - 5530 Yvoir - Belgique 
d Service d’Hématologie biologique, Pôle Laboratoires, PHU7, CHU de Nantes, 9, Quai Moncousu - 44000 Nantes - France 

*correspondance.

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Résumé

La cytométrie en flux est devenue de plus en plus sophistiquée au fil du temps et est maintenant généralement qualifiée de « multiparamétrique ». Aux représentations biparamétriques conventionnelles séquentielles, s’ajoute maintenant la possibilité d’analyses prenant en compte les espaces multidimensionnels intégrant toutes les caractéristiques de chaque cellule analysée. Grâce aux progrès réalisés pour l’exploitation des données encore plus complexes de la cytométrie de masse, de nouveaux logiciels ouvrent la voie vers un nouveau paradigme d’analyse des données de cytométrie en flux. Cet article de revue générale positionne ces nouvelles technologies et donne quelques exemples de ces applications novatrices.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Summary

Flow cytometry analysis has become more and more sophisticated over time and is now classically designed as “multiparametric”. Conventional biparametric displays have recently been complemented by new tools taking into account the multidimensional spaces integrating all characteristics of each cell studied. The highly complex data generated by mass cytometry induced the development of new paradigms applicable also to flow cytometry. This review paper describes such new technologies and provides some examples of novel applications.

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Mots-clés : Analyse non supervisée, cytométrie en flux multiparamétrique, R forge

Keyword : Unsupervised analysis, multiparameter flow cytometry, R forge


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Vol 2017 - N° 495

P. 57-61 - septembre 2017 Retour au numéro
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