S'abonner

Early steps of metabolism evolution inferred by cladistic analysis of amino acid catabolic pathways - 23/03/08

Chomin Cunchillos a, Guillaume Lecointre b,
a Institut Charles-Darwin-International, BP 70, 93230 Romainville, France 
b Service de systématique moléculaire et laboratoire d'ichtyologie générale et appliquée (Institut de systématique, FR CNRS 1541), Muséum national d'histoire naturelle, 43, rue Cuvier, 75231 Paris cedex 05, France 

*Corresponding author

Bienvenue sur EM-consulte, la référence des professionnels de santé.
L’accès au texte intégral de cet article nécessite un abonnement.

pages 11
Iconographies 3
Vidéos 0
Autres 0

Abstract

Among abiotic molecules available in primitive environments, free amino acids are good candidates as the first source of energy and molecules for early protocells. Amino acid catabolic pathways are likely to be one of the very first metabolic pathways of life. Among them, which ones were the first to emerge? A cladistic analysis of catabolic pathways of the sixteen aliphatic amino acids and two portions of the Krebs cycle is performed using four criteria of homology. The cladogram shows that the earliest pathways to emerge are not portions of the Krebs cycle but catabolisms of aspartate, asparagine, glutamate, glutamine, proline, arginine. Earliest enzymatic catabolic functions were deaminations and transaminations. Later on appeared enzymatic decarboxylations. The consensus tree allows to propose four time spans for catabolism development and corroborates the views of Cordón in 1990 about the evolution of catabolism.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Résumé

Parmi les molécules abiotiques disponibles dans les environnements primitifs, les acides aminés libres sont de bons candidats comme première source d'énergie et d'atomes pour les protobiontes. Le catabolisme des acides aminés fait probablement partie des toutes premières voies métaboliques du vivant. Parmi ces voies cataboliques, lesquelles furent les premières ? Une analyse cladistique des voies cataboliques des seize acides aminés aliphatiques et de deux portions du cycle de Krebs est conduite à partir de quatre critères d'homologie. Le cladogramme résultant montre que les premières voies ne sont pas des portions du cycle de Krebs mais celles du catabolisme de l'aspartate, de l'asparagine, du glutamate, de la glutamine, proline, arginine. Les premières fonctions enzymatiques du catabolisme sont les désaminations et les transaminations, suivies plus tard par les décarboxylations. L'arbre consensus permet de proposer quatre fenêtres temporelles du développement du catabolisme, quatre « époques » qui corroborent les hypothèses formulées par Cordón en 1990 sur l'évolution du catabolisme.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : aminoacids, cladistic analysis, catabolism, evolution of metabolism

Mots-clé : acides aminés, analyse cladistique, catabolisme, évolution du métabolisme


Plan


© 2002  Académie des sciences / Éditions scientifiques et médicales Elsevier SAS. Tous droits réservés.
Ajouter à ma bibliothèque Retirer de ma bibliothèque Imprimer
Export

    Export citations

  • Fichier

  • Contenu

Vol 325 - N° 2

P. 119-129 - février 2002 Retour au numéro
Article précédent Article précédent
  • What are African monarchs (Aves, Passeriformes)? A phylogenetic analysis of mitochondrial genes
  • Éric Pasquet, Alice Cibois, François Baillon, Christian Érard
| Article suivant Article suivant
  • Coding of insertion-deletion events of the chloroplastic intergene atpβ-rbcL for the phylogeny of the Valerianeae tribe (Valerianaceae)
  • María B Raymúndez, Joël Mathez, Nereida Xena de Enrech, Jean-Yves Dubuisson

Bienvenue sur EM-consulte, la référence des professionnels de santé.
L’accès au texte intégral de cet article nécessite un abonnement.

Bienvenue sur EM-consulte, la référence des professionnels de santé.
L’achat d’article à l’unité est indisponible à l’heure actuelle.

Déjà abonné à cette revue ?

Mon compte


Plateformes Elsevier Masson

Déclaration CNIL

EM-CONSULTE.COM est déclaré à la CNIL, déclaration n° 1286925.

En application de la loi nº78-17 du 6 janvier 1978 relative à l'informatique, aux fichiers et aux libertés, vous disposez des droits d'opposition (art.26 de la loi), d'accès (art.34 à 38 de la loi), et de rectification (art.36 de la loi) des données vous concernant. Ainsi, vous pouvez exiger que soient rectifiées, complétées, clarifiées, mises à jour ou effacées les informations vous concernant qui sont inexactes, incomplètes, équivoques, périmées ou dont la collecte ou l'utilisation ou la conservation est interdite.
Les informations personnelles concernant les visiteurs de notre site, y compris leur identité, sont confidentielles.
Le responsable du site s'engage sur l'honneur à respecter les conditions légales de confidentialité applicables en France et à ne pas divulguer ces informations à des tiers.


Tout le contenu de ce site: Copyright © 2024 Elsevier, ses concédants de licence et ses contributeurs. Tout les droits sont réservés, y compris ceux relatifs à l'exploration de textes et de données, a la formation en IA et aux technologies similaires. Pour tout contenu en libre accès, les conditions de licence Creative Commons s'appliquent.