Early steps of metabolism evolution inferred by cladistic analysis of amino acid catabolic pathways - 23/03/08
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Abstract |
Among abiotic molecules available in primitive environments, free amino acids are good candidates as the first source of energy and molecules for early protocells. Amino acid catabolic pathways are likely to be one of the very first metabolic pathways of life. Among them, which ones were the first to emerge? A cladistic analysis of catabolic pathways of the sixteen aliphatic amino acids and two portions of the Krebs cycle is performed using four criteria of homology. The cladogram shows that the earliest pathways to emerge are not portions of the Krebs cycle but catabolisms of aspartate, asparagine, glutamate, glutamine, proline, arginine. Earliest enzymatic catabolic functions were deaminations and transaminations. Later on appeared enzymatic decarboxylations. The consensus tree allows to propose four time spans for catabolism development and corroborates the views of Cordón in 1990 about the evolution of catabolism.
Le texte complet de cet article est disponible en PDF.Résumé |
Parmi les molécules abiotiques disponibles dans les environnements primitifs, les acides aminés libres sont de bons candidats comme première source d'énergie et d'atomes pour les protobiontes. Le catabolisme des acides aminés fait probablement partie des toutes premières voies métaboliques du vivant. Parmi ces voies cataboliques, lesquelles furent les premières ? Une analyse cladistique des voies cataboliques des seize acides aminés aliphatiques et de deux portions du cycle de Krebs est conduite à partir de quatre critères d'homologie. Le cladogramme résultant montre que les premières voies ne sont pas des portions du cycle de Krebs mais celles du catabolisme de l'aspartate, de l'asparagine, du glutamate, de la glutamine, proline, arginine. Les premières fonctions enzymatiques du catabolisme sont les désaminations et les transaminations, suivies plus tard par les décarboxylations. L'arbre consensus permet de proposer quatre fenêtres temporelles du développement du catabolisme, quatre « époques » qui corroborent les hypothèses formulées par Cordón en 1990 sur l'évolution du catabolisme.
Le texte complet de cet article est disponible en PDF.Keywords : aminoacids, cladistic analysis, catabolism, evolution of metabolism
Mots-clé : acides aminés, analyse cladistique, catabolisme, évolution du métabolisme
Plan
Vol 325 - N° 2
P. 119-129 - février 2002 Retour au numéroBienvenue sur EM-consulte, la référence des professionnels de santé.
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