Intérêts et limites de la quantification de l’ADN VIH - 27/03/08
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Intérêts et limites de la quantification de l’ADN VIH. Comparaison des quantifications de l’ADN proviral lors des infections par VIH-1 et par VIH-2 |
Objectifs. L’infection par VIH-2 est moins pathogène que celle par VIH-1 et les charges virales plasmatiques VIH-2 sont très inférieures à celles observées lors des infections par VIH-1. Ces différences d’histoire naturelle entre les deux infections en font un modèle d’étude idéal pour évaluer l’intérêt de la quantification des différentes formes de l’ADN VIH.
Méthodes. Pour comparer les quantités d’ADN total et d’ADN sous forme circularisée à 2-LTR lors des infections par VIH-1 et par VIH-2, nous avons mis au point des PCR quantitatives en temps réel avec des standards communs aux deux virus. Ces techniques ont été appliquées in vitro à la quantification des ADN VIH-1 ou VIH-2 lors des cycles de réplication en cultures de PBMC humains de différents donneurs et sur différentes lignées cellulaires. Les quantités d’ADN ont été également comparées entre 44 patients infectés par VIH-1 et 41 patients infectés par VIH-2 à des stades identiques d’immunodépression et naïfs de traitement antirétroviral.
Résultats. Quelles que soient les PBMC et les lignées cellulaires, la quantité d’ADN total des souches VIH-2 reste inférieure à celle des souches VIH-1 jusqu’à 96 heures ; en revanche VIH-2 produit plus de formes à 2-LTR que VIH-1. Chez les patients, la différence entre les charges virales ADN total VIH-1 et VIH-2 est hautement significative pour les patients avec plus de 300 CD4/µl. Nous mettons en évidence des différences de production in vitro entre les ADN totaux des deux types de VIH et confirmons cette différence chez les patients naïfs avec plus de 300 CD4/µl. Inversement, nous mettons en évidence in vitro une accumulation plus importante des formes d’ADN circularisés à 2-LTR lors des infections par VIH-2.
Conclusion. Notre travail confirme l’intérêt de ces marqueurs ADN totaux et circularisés et montre que la quantification de l’ADN est parallèle à l’histoire naturelle des VIH, l’accumulation des formes à 2-LTR pouvant correspondre à une moindre capacité d’intégration du VIH-2.
Advantages and limits in quantification of HIV-DNA. Comparison of quantifications of proviral DNA in HIV-1 and HIV-2 |
Objectives. The lesser pathogenicity of HIV-2 relative to HIV-1 is generally attributed to its slower replication. The objectives were to compare the amounts of total DNA and 2-LTR circular DNA during HIV-1 and HIV-2 infection.
Methods. We developed quantitative real-time PCR methods based on two plasmid calibrators bearing sequences corresponding to both HIV-1 and HIV-2. Quantifications of total and circular HIV-1 and HIV-2 DNA were applied in vitro to replication cycles in cultures of PBMC and cell lines. Viral DNA production was also compared between 44 HIV-1 and 41 HIV-2-infected antiretroviral-naïve patients.
Results. With all the different PBMC and the cell lines, we found a sharp difference in the DNA kinetics of the viruses: the total amount of DNA was lower with HIV-2 than with HIV-1. Conversely, 2-LTR DNA appeared later with HIV-2 than with HIV-1, whereas 2-LTR DNA production rapidly became more abundant with HIV-2 than with HIV-1. In patients, the difference between HIV-1 and HIV-2 total proviral DNA loads was significant in those with CD4 cell counts above 300 CD4/µl.
Conclusion. We observed early differences in total DNA production between HIV-1 and HIV-2 and paradoxically, a stronger accumulation of 2-LTR circular DNA.
Mots clés : Infection VIH-2 , VIH-1 , charge virale plasmatique , PCR quantitative , quantification ADN VIH-1/VIH-2
Keywords:
HIV-2 infection
,
HIV-1
,
plasma viral load
,
quantitative PCR
,
quantification DNA.HIV-1/HIV-2
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Vol 9 - N° 3
P. 199-203 - septembre 2007 Retour au numéroBienvenue sur EM-consulte, la référence des professionnels de santé.
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