L'examen microscopique est fondamental pour le diagnostic de la tuberculose (TB) pulmonaire et traduit souvent la contagiosité du patient. Le test Xpert® MTB/RIF utilisant 5 sondes se liant au gène rpoB est une méthode rapide qui peut être réalisée directement sur le prélèvement. Dans cette étude, nous avons évalué l'apport du CT (« Cycle Threshold ») du test Xpert® MTB/RIF pour estimer la charge bacillaire et la contagiosité des patients.

Analyse rétrospective des patients issus de la cohorte CO1TB. Les critères d'inclusion étaient: TB pulmonaire + positivité de la culture et du Xpert® MTB/RIF entre 2018 et 2020. Pour chaque cas, le CT médian (CT) a été calculé à partir du résultat des 5 sondes. Nous avons étudié les corrélations suivantes: entre le CT et l'examen microscopique (EM) à J0, le CT et le délai de positivité de la culture (DPC, reflet de la charge bacillaire dans la littérature) à J0, ainsi que la corrélation entre le CT et l'EM et la culture (C) à J15 en utilisant le coefficient de corrélation de Sperman.

Au total, 39 patients ont été inclus. Le CT médian était de 18,1, intervalle interquartile [15,2-20,5]. Le CT était significativement corrélé au nombre de BAAR/champ au diagnostic (r = - 0.49, p=0,001) avec une valeur médiane du CT de 24,0 [18,7-28,7] pour les patients avec EM négatif (EM-) (n=4), de 19.5 [17,3-22,2] pour un grade faible à 1 (<1 à 9 BAAR/champ) (n=19), 16.2 [14,8-17,6] pour un grade 2 (10 à 100 BAAR/champ) (n=15) et de 12.7 pour un grade 3 (>100 BAAR/champ) (n=1), respectivement (p=0,019).

Le DPC médian en milieu liquide était de 6 jours [4-8] avec des extrêmes allant de 1 à 15 jours. Le DPC était significativement corrélé au CT à J0 (r = 0.59, p<0,0001) avec une valeur médiane du CT de 15,4 [13,9-17,2] pour les C+ en 5 jours ou moins, de 19,8 [17,8-22,4] pour les cultures ayant poussé entre 6 et 10 jours et 22,3 [19,9-25,8] pour les C+ en 11 à 15 jours respectivement (p=0,008).

Sur les 29 résultats d'EM disponibles à J15, 14 étaient encore positifs avec une valeur médiane du CT à J0 de 18,3 [15,6-19,6] contre 20,1 [16,6-22,2] pour les négatifs (n=15)(p=0,57).

Sur 23 résultats de culture des crachats disponibles à J15, 16 étaient positives avec une valeur médiane de CT à J0 de 18,9 [16,7-21,3] et 7 étaient stériles avec une valeur médiane du CT de 22.2 [17,2-24,9] (p=0,13).

Dans notre étude, la valeur du CT est corrélée avec la charge bacillaire au diagnostic et apporte ainsi un éclairage utile sur le niveau de contagiosité des patients. Cette information est capitale dans les pays à faible ressources où l'Xpert est maintenant disponible et où l'examen microscopique et surtout la culture ne le sont pas. Le CT n'était pas statistiquement associé aux résultats obtenus à J15. Une étude prospective avec une bonne standardisation des prélèvements bactériologiques et des effectifs plus importants permettrait de mieux préciser l'apport éventuel du CT à J0 dans la prédiction du délai de positivité des cultures et sa place en pratique clinique.

Aucun lien d'intérêt