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Proteomics-Based Mapping of Bronchopulmonary Dysplasia-Associated Changes in Noninvasively Accessible Oral Secretions - 12/06/24

Doi : 10.1016/j.jpeds.2023.113774 
Saima Ahmed, MS 1, 2, , Oludare A. Odumade, MD, PhD 2, 3, 4, , Patrick van Zalm, MS 1, 2, Benoit Fatou, PhD 1, 2, 4, Rachel Hansen, BS 5, Camilia R. Martin, MD, MS 6, Asimenia Angelidou, MD, PhD 2, 4, 5, , Hanno Steen, PhD 1, 2, 4, ,
1 Department of Pathology, Boston Children's Hospital, Boston, MA 
2 Harvard Medical School, Boston, MA 
3 Division of Neonatology, Boston Children's Hospital and Harvard Medical School, Boston, MA 
4 Precision Vaccines Program, Department of Pediatrics, Boston Children's Hospital, Harvard Medical School, Boston, MA 
5 Department of Neonatology, Beth Israel Deaconess Medical Center, Boston, MA 
6 Division of Neonatology, Weill Cornell Medicine, New York, NY 

Reprint requests: Hanno Steen, PhD, Department of Pathology, Boston Children ’s Hospital, 300 Longwood Avenue, Boston, MA 02115.Department of Pathology, Boston Children ’s Hospital300 Longwood AvenueBostonMA02115

Abstract

Objective

To determine if oral secretions (OS) can be used as a noninvasively collected body fluid, in lieu of tracheal aspirates (TA), to track respiratory status and predict bronchopulmonary dysplasia (BPD) development in infants born <32 weeks.

Study design

This was a retrospective, single center cohort study that included data and convenience samples from week-of-life (WoL) 3 from 2 independent preterm infant cohorts. Using previously banked samples, we applied our sample-sparing, high-throughput proteomics technology to compare OS and TA proteomes in infants born <32 weeks admitted to the Neonatal Intensive Care Unit (NICU) (Cohort 1; n = 23 infants). In a separate similar cohort, we mapped the BPD-associated changes in the OS proteome (Cohort 2; n = 17 infants including 8 with BPD).

Results

In samples collected during the first month of life, we identified 607 proteins unique to OS, 327 proteins unique to TA, and 687 overlapping proteins belonging to pathways involved in immune effector processes, neutrophil degranulation, leukocyte mediated immunity, and metabolic processes. Furthermore, we identified 37 OS proteins that showed significantly differential abundance between BPD cases and controls: 13 were associated with metabolic and immune dysregulation, 10 of which (eg, SERPINC1, CSTA, BPI) have been linked to BPD or other prematurity-related lung disease based on blood or TA investigations, but not OS.

Conclusions

OS are a noninvasive, easily accessible alternative to TA and amenable to high-throughput proteomic analysis in preterm newborns. OS samples hold promise to yield actionable biomarkers of BPD development, particularly for prospective categorization and timely tailored treatment of at-risk infants with novel therapies.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : very preterm newborn, mass spectrometry, biomarkers, body fluids

Abbreviations : ANXA1, ANXA8, ANXA8L1, BIDMC, BPD, BPI, CSTA, FDR, GA, IGKV3-20, MS, NICU, OS, PCA, RDS, SERPINC1, TA, TKT, TPP2, WoL


Plan


 Funding Sources: The Nutrition and Infant Health Repository was supported by the Douglas K. Richardson Funding Program of the Department of Neonatology, Beth Israel Deaconess Medical Center, Boston, MA. This study was supported by an NIAID Development of Sample Sparing Assays for Monitoring Immune Responses Infrastructure and Opportunity Fund (IOF) award supplementing NIH/NIAID 5 U24 AI152179-03 (HS).


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