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Genetic Testing in Pediatric Epilepsy: Tools, Tips, and Navigating the Traps - 16/07/24

Doi : 10.1016/j.pediatrneurol.2024.05.008 
Sayoni Roy Chowdhury, MD, DM (Paediatric Neurology) a, Robyn Whitney, MD, CSCN (EEG) b, Rajesh RamachandranNair, MD, DM, CSCN (EEG) b, Sunita Bijarnia Mahay, DCH, DNB (Ped) c, Suvasini Sharma, MD, DM (Paediatric Neurology) a,
a Department of Paediatrics, Lady Hardinge Medical College and Associated Kalawati Saran Children's Hospital, New Delhi, India 
b Comprehensive Paediatric Epilepsy Program, Division of Neurology, Department of Pediatrics, McMaster Children's Hospital, Hamilton, Ontario, Canada 
c Sr. Consultant, Clinical & Metabolic Geneticist, Institute of Medical Genetics & Genomics, Sir Ganga Ram Hospital, New Delhi, India 

Communications should be addressed to: Dr. Sharma; Professor; Department of Pediatrics; Lady Hardinge Medical College and Associated Kalawati Saran Children's Hospital; Connaught Place, New Delhi 110001, India.Department of PediatricsLady Hardinge Medical College and Associated Kalawati Saran Children's HospitalConnaught PlaceNew Delhi110001India

Abstract

With the advent of high-throughput sequencing and computational methods, genetic testing has become an integral part of contemporary clinical practice, particularly in epilepsy. The toolbox for genetic testing has evolved from conventional chromosomal microarray and epilepsy gene panels to state-of-the-art sequencing techniques in the modern genomic era. Beyond its potential for therapeutic benefits through precision medicine, optimizing the choice of antiseizure medications, or exploring nonpharmacological therapeutic modalities, genetic testing carries substantial diagnostic, prognostic, and personal implications. Developmental and epileptic encephalopathies, the coexistence of neurodevelopmental comorbidities, early age of epilepsy onset, unexplained drug-refractory epilepsy, and positive family history have demonstrated the highest likelihood of yielding positive genetic test results. Given the diagnostic efficacy across different testing modalities, reducing costs of next-generation sequencing tests, and genetic diversity of epilepsies, exome sequencing or genome sequencing, where feasible and available, have been recommended as the first-tier test. Comprehensive clinical phenotyping at the outset, corroborative evidence from radiology and electrophysiology-based investigations, reverse phenotyping, and periodic reanalysis are some of the valuable strategies when faced with inconclusive test results. In this narrative review, the authors aim to simplify the approach to genetic testing in epilepsy by guiding on the selection of appropriate testing tools in the indicated clinical scenarios, addressing crucial aspects during pre- and post-test counseling sessions, adeptly navigating the traps posed by uncertain or negative genetic variants, and paving the way forward to the emerging testing modalities beyond DNA sequencing.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : Epilepsy, Developmental and epileptic encephalopathies, Next-generation sequencing, Microarray, Genetic counseling


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 Disclosures: The authors report no disclosures relevant to the manuscript.
 Role of funding source: The authors report no targeted funding.


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