En Amazonie, les conditions climatiques pourraient modifier les agents infectieux responsables des abcès cutanés, largement dominés par S. aureus sensible à la méthicilline (SAMS) en métropole. Dans notre institution, l'antibiothérapie probabiliste dans cette indication est l'amoxicilline-acide clavulanique sauf pour les morsures de serpents où piperacilline-tazobactam est préconisée.

Etude prospective monocentrique du 01/01/2023 au 15/01/2024. Tous les patients hospitalisés en chirurgie pour mise à plat d'abcès étaient éligibles.

Eléments recueillis : facteur déclenchant, localisation, documentation microbiologique, complications. Statistique: test du Chi-2 pour les variables catégorielles, test de Student pour les variables continues (logiciel Stata).

118 patients inclus d’âge moyen 42 ans ± 15 dont 75 % (88) d'hommes avec peu de comorbidités. 67 (57 %) des abcès étaient localisés au tronc ou au membre supérieur (MS), 51 (43 %) au membre inférieur (MI). 32 (27 %) des abcès se sont compliquées (16 infections ostéo-articulaires, 7 fasciites nécrosantes, 6 amputations, 6 évolutions défavorables nécessitant une reprise chirurgicale). Les infections à Cocci Gram+ étaient majoritaires (75 % des cas) dont 63 (53 %) de SAMS. Les abcès à SAMS étaient majoritairement monomicrobiens (66 %, 55/83 vs 34 % [12/35], p = 0,001), associés au membre supérieur (76 % [51/67] vs 31 % [16/51], p < 0,001) et de meilleur pronostic: 34 % (11/32) des complications vs 60 % (52) des abcès non compliqués (p < 0,01). Au moins un bacille Gram négatif (BGN) était retrouvé dans 34 % (40) des cas dont 20 % (23) d'entérobactérie du groupe 3 et 17 % (20) d’Aeromonas sp. Ces deux types de microorganismes présentaient des caractéristiques similaires: association significative aux morsures de serpent (p < 0,001), à une localisation au membre inférieurs (p < 0,004 et < 0,001 respectivement), au caractère polymicrobien (p < 0,001). 43 % (10/23) des abcès avec des entérobactéries du groupe 3 a présenté une complication (p = 0,049).

Dans cette population précaire en zone amazonienne, fortement exposée aux contaminations de l'environnement, SAMS est le premier microorganisme isolé, majoritairement au membre supérieur. Aeromonas et les entérobactéries du groupe 3 sont également fréquemment isolés, surtout aux membres inférieurs (exposés aux souillures telluriques et animales, serpent surtout). Ils sont associés à un moins bon pronostic. Après cette étude, le nouveau protocole de traitement comprend : sulfaméthoxazole + triméthoprime pour les abcès secondaire à une morsure de serpent ou localisé au MI, surtout si souillure aquatique ; céfépime pour les cas sévères. Les abcès du MS peuvent être traités par amoxicilline-acide clavulanique ou clindamycine.