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Exploring geographic differences in IgE response through network and manifold analyses - 05/01/26

Doi : 10.1016/j.jaci.2025.05.032 
Alex Cucco, PhD a, b, Neil Pearce, PhD c, Angela Simpson, MD, PhD d, Lucy Pembrey, PhD c, Harriet Mpairwe, PhD e, Camila A. Figueiredo, PhD f, Philip J. Cooper, PhD g, h, i, Jeroen Douwes, PhD j, Collin Brooks, PhD j, Ian M. Adcock, PhD a, Nazanin Zounemat Kermani, PhD a, Graham D.M. Roberts, MD PhD k, Clare S. Murray, MD d, Adnan Custovic, MD, PhD, FMedSci a, , Sara Fontanella, PhD a
for the

WASP Study Group

Neil Pearce, Lucy Pembrey, Steven Robertson, Karin van Veldhoven, Charlotte E. Rutter, Sinead Langan, Sarah Thorne, Donna Davoren, John Henderson, Susan Ring, Elizabeth Brierley, Sophie Fitzgibbon, Simon Scoltock, Amanda Hill, Alvaro Cruz, Camila Figueiredo, Mauricio Barreto, Cinthia Vila Nova Santana, Gabriela Pimentel, Gilvaneide Lima, Valmar Bião Lima, Jamille Fernandes, Tamires Cana Brasil Carneiro, Candace Andrade, Gerson Queiroz, Anaque Pires, Milca Silva, Jéssica Cerqueira, Philip Cooper, Martha Chico, Cristina Ardura-Garcia, Araceli Falcones, Aida Y. Oviedo, Andrea Zambrano, Jeroen Douwes, Collin Brooks, Hajar Ali, Jeroen Burmanje, Harriet Mpairwe, Irene Nambuya, Pius Tumwesige, Milly Namutebi, Marble Nnaluwooza, Mike Mukasa

the

STELAR/UNICORN Consortium

Stephen Turner, John W. Holloway, Syed Hasan Arshad, John A. Curtin, Ashley Woodcock, Raquel Granell, Andrew Bush, Sejal Saglani

and the

U-BIOPRED Consortium

  Members of the study groups are listed in the Acknowledgments.
H. Ahmed, C. Auffray, P. Bakke, A.T. Bansal, F. Baribaud, S. Bates, E.H. Bel, J. Bigler, H. Bisgaard, M.J. Boedigheimer, K. Bønnelykke, J. Brandsma, P. Brinkman, E. Bucchioni, D. Burg, A. Bush, M. Caruso, A. Chaiboonchoe, P. Chanez, F.K. Chung, C.H. Compton, J. Corfield, A. D’Amico, B. Dahlén, S.E. Dahlén, B. De Meulder, R. Djukanovic, V.J. Erpenbeck, D. Erzen, K. Fichtner, N. Fitch, L.J. Fleming, E. Formaggio, S.J. Fowler, U. Frey, M. Gahlemann, T. Geiser, V. Goss, Y. Guo, S. Hashimoto, J. Haughney, G. Hedlin, P.W. Hekking, T. Higenbottam, J.M. Hohlfeld, C. Holweg, I. Horváth, P. Howarth, A.J. James, R.G. Knowles, A.J. Knox, N. Krug, D. Lefaudeux, M.J. Loza, R. Lutter, A. Manta, S. Masefield, J.G. Matthews, A. Mazein, A. Meiser, R.J.M. Middelveld, M. Miralpeix, P. Montuschi, N. Mores, J. Musial, D. Myles, L. Pahus, I. Pandis, S. Pavlidis, A. Postle, P. Powel, G. Praticò, M. Puig Valls, N. Rao, J. Riley, A. Roberts, A. Rowe, T. Sandström, J.P.R. Schofield, W. Seibold, A. Selby, D.E. Shaw, R. Sigmund, F. Singer, P.J. Skipp, A.R. Sousa, P.J. Sterk, K. Sun, W.M. van Aalderen, B. Thornton, M. van Geest, J. Vestbo, N.H. Vissing, A.H. Wagener, S.S. Wagers, Z. Weiszhart, C.E. Wheelock, S.J. Wilson

a National Heart and Lung Institute, Imperial College London, London, United Kingdom 
b Department of Socio-Economic, Managerial, and Statistical Studies, University “G. d’Annunzio” of Chieti-Pescara, Pescara, Italy 
c Department of Medical Statistics, London School of Hygiene & Tropical Medicine, London, United Kingdom 
d Faculty of Biology, Medicine and Health, University of Manchester, Manchester, United Kingdom 
e MRC/UVRI and LSHTM Uganda Research Unit, Entebbe, Uganda 
f Federal University of Bahia, Salvador, Brazil 
g Fundacion Ecuatoriana Para Investigacion en Salud, Quito, Brazil 
h School of Medicine, Universidad Internacional del Ecuador, Quito, Brazil 
i Institute of Infection and Immunity, St George’s University of London, London, United Kingdom 
j Centre for Public Health Research, Massey University, Wellington, New Zealand 
k Human Development and Health, Faculty of Medicine, University of Southampton, Southampton, United Kingdom 

Corresponding author: Adnan Custovic, MD, PhD, FMedSci, National Heart and Lung Institute, Imperial College London, Hammersmith Campus, Du Cane Road, London, W12 0NN, England, United Kingdom.National Heart and Lung InstituteImperial College LondonSt Mary’s Campus Medical SchoolLondonEnglandW21PGUnited Kingdom

Abstract

Background

Component-resolved diagnostics allow detailed assessment of IgE sensitization to multiple allergenic molecules (component-specific IgEs, or c-sIgEs) and may be useful for asthma diagnosis. However, to effectively use component-resolved diagnostics across diverse settings, it is crucial to account for geographic differences.

Objective

We investigated spatial determinants of c-sIgE networks to facilitate development of diagnostic algorithms applicable globally.

Methods

We used multiplex component-resolved diagnostics array to measure c-sIgE to 112 proteins in an international collaboration of several studies: WASP (World Asthma Phenotypes; United Kingdom, New Zealand, Brazil, Ecuador, and Uganda), U-BIOPRED (Unbiased Biomarkers for the Prediction of Respiratory Disease Outcomes; 7 European countries), and MAAS (Manchester Asthma and Allergy Study, a UK population-based birth cohort). Hierarchical clustering on low-dimensional representation of co-occurrence networks ascertained sensitization and c-sigE clusters across populations. Cross-country comparisons focused on a common subset of 18 c-sIgEs. We investigated sensitization networks across regions in relation to asthma severity.

Results

Sensitization profiles shared similarities across regions. For 18 c-sIgEs shared across study populations, the response structure enabled differentiation between different geographic areas and study designs, revealing 3 clusters: (1) Uganda, Ecuador, and Brazil, (2) U-BIOPRED children and adults, and (3) New Zealand, United Kingdom, and MAAS. Spectral clustering identified differences between clusters. We observed constant, almost parallel shifts between severe and nonsevere asthma in each country.

Conclusions

Patterns of c-sIgE response reflect geographic location and study design. However, despite geographic differences in c-sIgE networks, there is a remarkably consistent shift between networks of subjects with nonsevere and severe asthma.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Key words : Asthma, allergic sensitization, cluster, network analysis, component-resolved diagnostics, statistical network analysis, asthma diagnosis

Abbreviations used : Alpha-gal, ALSPAC, CRD, c-sIgE, HC, MAAS, sIgE, U-BIOPRED, WASP


Plan


 The last 2 authors contributed equally to this article, and both should be considered senior author.
 This work forms part of a submitted PhD thesis, which will be publicly available in the Imperial College repository, Spiral, under a CC BY-NC license after a minimum 2-year embargo period (extendable).


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Vol 157 - N° 1

P. 262-272 - janvier 2026 Retour au numéro
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  • Prediction and characterization of genetically regulated expression of asthma tissues from African-ancestry populations
  • Sarah D. Slack, Erika Esquinca, Christopher H. Arehart, Meher Preethi Boorgula, Brooke Szczesny, Alex Romero, Monica Campbell, Sameer Chavan, Nicholas Rafaels, Harold Watson, R. Clive Landis, Nadia N. Hansel, Charles N. Rotimi, Christopher O. Olopade, Camila A. Figueiredo, Carole Ober, Andrew H. Liu, Eimear E. Kenny, Kai Kammers, Ingo Ruczinski, Margaret A. Taub, Michelle Daya, Christopher R. Gignoux, Katerina Kechris, Kathleen C. Barnes, Rasika A. Mathias, Randi K. Johnson
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