Open data : objectif principal atteint pour les data challenges de la Société Française de Pathologie - 23/01/26

Open data: main objective achieved for the French Society of Pathology's data challenges

Doi : 10.1016/j.annpat.2025.12.009

Philippe Bertheau ^a,⁎ , Laurie Alla ^b, Agathe Delaune ^b, Nicolas Loménie ^c, Amir Khammari ^d, Eve Maubec ^e, Frédéric Staroz ^f, Sophie Prévot ^g

^a Service de pathologie, hôpital Saint-Louis, GHU Nord AP–HP et université Paris Cité, Paris, France

^b Health Data Hub, 9, rue Georges-Pitard, 75015 Paris, France

^c Université Paris Cité, LIPADE, 75006 Paris, France

^d Département de dermatologie, CIC 1413, INSERM UMR 1302/EMR6001 INCIT, CHU de Nantes, Nantes université, Nantes, France

^e Assistance publique Hôpitaux de Paris, hôpital Avicenne, université Sorbonne Paris Nord, Bobigny, université Paris Cité, inserm UMR 1124, Paris, France

^f Ouest pathologie, Quimper, France

^g Service de Pathologie hôpital de Bicêtre, GHU Paris Saclay et université Paris Saclay, Le Kremlin Bicêtre, France

^⁎ Auteur correspondant.

Sous presse. Épreuves corrigées par l'auteur. Disponible en ligne depuis le Friday 23 January 2026

Résumé

La Société française de pathologie a organisé deux data challenges avec le soutien du Health Data Hub : TissueNet en 2020 consacré aux lésions du col de l’utérus et Visiomel en 2023 consacré au mélanome en partenariat avec la Société française de dermatologie et le Conseil national professionnel des pathologistes. Les jeux de données ont été ouverts aux compétiteurs du monde entier pendant quelques semaines lors de chaque challenge, mais ces données ont ensuite été refermées en attendant une ouverture complète et pérenne appelée open data. Cette étape ultime permet un accès libre, gratuit et constant aux données afin de promouvoir à l’échelle mondiale tous programmes de recherche dans ces maladies. Les données des deux data challenges sont en open data sur data.gouv.fr depuis janvier 2025 pour TissueNet ( tissuenet-detect-lesions-in-uterine-cervix-specimens-open-data-set/ ) et depuis septembre 2025 pour Visiomel ( visiomel-database-predicting-cutaneous-melanoma-relapse/ ). La mise en open data de données de santé est un processus multi-étapes contraignant, à la fois aux plans organisationnel, technique et réglementaire, et c’est ce processus que nous décrivons ici.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Summary

The French Society of Pathology organized two data challenges, with the support of the Health Data Hub: TissueNet in 2020, focusing on cervical lesions, and Visiomel in 2023 dedicated to melanoma in partnership with the French Society of Dermatology and the National Professional Council of Pathologists. The datasets were open a few weeks to competitors worldwide during each challenge. However, these data were then closed, awaiting a complete and permanent opening, known as open data. This ultimate step allows free access to the data to promote global research programs in these diseases. The data from the two data challenges have been available as open data on data.gouv.fr since January 2025 for TissueNet ( tissuenet-detect-lesions-in-uterine-cervix-specimens-open-data-set/ ) and since September 2025 for Visiomel ( visiomel-database-predicting-cutaneous-melanoma-relapse/ ). Making health data open is a demanding multi-step process – organizationally, technically, and regulatorily – and it is this process that we discuss here.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Mots clés : Open data, Data challenge, Col utérin, Mélanome, SFP

Keywords : Open data, Data challenge, Uterus cervix, Melanoma, SFP