Le sepsis est une affection médicale complexe associée à une mortalité élevée. L’objectif de l’étude était d’étudier l’impact de la pandémie de Covid-19 sur l’effet des facteurs associés à la mortalité intrahospitalière, en particulier l’étiologie du sepsis.

Sur la période 2018-2022, pour les patients âgés de 15 ans ou plus, le dernier séjour annuel avec sepsis et passage en réanimation a été retenu. L’identification de sepsis d’origine virale a, pour la plupart, combiné des codes CIM-10 d’infection associés à des passage en réanimation et suppléance d’organe. L’impact de la pandémie a été étudiée par des modèles de régression de Cox multivariés avant et pendant la pandémie. Les analyses étaient stratifiées sur la présence ou l’absence d’une co-infection et ajustées sur l’âge, le sexe, les comorbidités, les sites d’infections et le choc septique.

Sur la période 2018-2022, un total de 604 517 patients ont été inclus, 29,2% sont décédés pendant leur séjour. Avant la pandémie, comparé au sepsis d’origine bactérienne, le sepsis d’origine virale était associé à un risque moindre de mortalité intrahospitalière, en présence de co-infection (HRa= 0,73; IC à 99% : 0,63-0,85) ou en l’absence de co-infection (HRa= 0,63; IC à 99% : 0,57-0,69) alors que pendant la pandémie ce dernier, principalement lié au Covid-19, était associé à un risque plus élevé (HRa= 1,41; IC à 99% : 1,06-1,88 et HRa= 1,14; IC à 99% : 1,10-1,19 pour les patients avec ou sans co-infection respectivement).

Comparé aux patients avec un sepsis d’origine bactérienne, la pandémie a modifié l’impact de l’étiologie du sepsis sur la mortalité intrahospitalière avec un risque de mortalité intrahospitalière plus élevé pour les sepsis d’origine virale. Afin de ne pas sous-estimer le fardeau associé au sepsis d’origine virale, il parait important de définir des codes CIM-10 explicites pour ces derniers.