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Machine-based classification of epileptiform activity in selected EEG excerpts from genetic generalised epilepsy - 27/08/26

Doi : 10.1016/j.neucli.2026.103191 
Juan Manuel Escobar-Montalvo a, b, Ana Maria Torres b, c, Fredy Escobar-Ipuz b, c, d, Jorge Mateo b, c, ⁎
a Henares University Hospital, Neurology and Clinical Neurophysiology Department, Madrid, Spain 
b Medical Analysis Expert Group, Castilla-La Mancha Institute of Health Research (IDISCAM), Toledo, 45071, Spain 
c Medical Analysis Expert Group, Institute of Technology, University of Castilla-La Mancha, Cuenca, 16071, Spain 
d General University Hospital of Ciudad Real, Clinical Neurophysiology Department, Ciudad Real, Spain 

⁎ Corresponding author at: Medical Analysis Expert Group, Campus Universitario s/n, University of Castilla-La Mancha, Cuenca, 16071, Spain. Medical Analysis Expert Group Campus Universitario s/n University of Castilla-La Mancha Cuenca 16071 Spain

Abstract

Objectives

To evaluate whether the deep learning model IGENet-TS, a time-domain convolutional neural network (CNN), can classify expert-selected EEG excerpts containing visible generalised epileptiform activity from genetic generalised epilepsy (GGE) versus normal healthy-control excerpts, and whether this selected-excerpt task generalises across centres.

Methods

We performed a retrospective selected-excerpt classification study of 455 routine 32-channel EEGs: 237 from Cuenca (107 GGE, 130 controls) for development and 218 from Bremen (106 GGE, 112 controls) for external testing. Each GGE recording contributed a 120-s resting-state segment containing at least one visible generalised discharge; controls contributed representative normal resting background. IGENet-TS analysed thirty non-overlapping 4-s windows per segment and averaged window probabilities to obtain a segment-derived label.

Results

Repeated 70:30 internal testing yielded sensitivity 98.15% (95% CI 97.52–98.78), specificity against healthy-control excerpts 97.95% (97.40–98.50), accuracy 98.04% (97.45–98.63), F1 98.05% (97.50–98.60) and AUC 0.98 (0.96–1.00). Externally, sensitivity was 97.02% (96.39–97.65), specificity against healthy-control excerpts 96.80% (96.19–97.41), accuracy 96.91% (96.24–97.58), F1 96.62% (95.97–97.27) and AUC 0.97 (0.95–0.99).

Discussion/Conclusion

The IGENet-TS model distinguished curated discharge-containing GGE excerpts from normal healthy-control excerpts with stable centre-separated performance. These results support technical feasibility for the selected-excerpt classification task, but do not validate unattended full-recording EEG interpretation or clinical workflow use.

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Graphical abstract




Image, graphical abstract

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Keywords : Electroencephalography, Genetic generalised epilepsy, Machine-based classification, Convolutional neural network, Clinical neurophysiology, Selected EEG excerpts, External validation, Saliency

Abbreviations : AUC, BLDA, CI, CNN, EEG, GGE, KNN, RF, SVM


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