Microarray analysis using bioinformatics analysis audit trails (BAATs) - 01/01/03
Matthew Bellgard * , Adam Hunter, William Kenworthy*Corresponding author.
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Résumé |
Bioinformatics analysis plays an integrative role in genomics and functional genomics. The ability to conduct quality managed, hypothesis-driven bioinformatics analysis with the plethora of data available is mandatory. Biological interpretation of this data is dependent on versions of databases, programs and the parameters used. Thus, tracking and auditing the analyses process is important. This paper outlines what we term Bioinformatics Analysis Audit Trails (BAATs) and describes YABI, a bioinformatics environment that implements BAATs. YABI can incorporate most bioinformatics tools within the same environment, making it a valuable resource. To cite this article: M. Bellgard et al., C. R. Biologies 326 (2003).
Résumé |
L'analyse bioinformatique joue un rôle intégrateur en génomique fonctionnelle. La capacité à conduire une analyse bioinformatique de qualité fondée sur des hypothèses est obligatoire avec la pléthore de données disponibles. L'interprétation biologique des données est dépendante des versions des bases de données, des programmes et des paramètres utilisés. Aussi, le traçage et l'audit des processus d'analyse sont importants. Cet article résume ce que nous appelons « chemins audités d'analyse bioinformatique » et décrit YABI, un environnement informatique qui les implémente. YABI peut incorporer la plupart des outils bioinformatiques dans un même environnement, ce qui en fait une ressource de valeur. Pour citer cet article : M. Bellgard et al., C. R. Biologies 326 (2003).
Mots clés : audit trails ; bioinformatics analysis pipelines comparative ; genomic sequence analysis ; microarray data analysis.
Mots clés : analyse comparative de séquence génomique ; analyse de microréseaux ; chemins audités ; pipeline d'analyse bioinformatique.
Plan
Vol 326 - N° 10-11
P. 1083-1087 - octobre-novembre 2003 Retour au numéroBienvenue sur EM-consulte, la référence des professionnels de santé.
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